聚类策略给出了已知的治疗方法

Question

是否有策略在一个条件中聚集组内的共享属性，知道条件应该激发两个组之间的差异？

一个具体的例子：说A组中有4个人，B组中有4个人.A组被引入StackOverflow，其他人只剩下他们的铁意志了。每个个体检查30 000个基因。我们期望与B组相比，A组个体应该相对无压力。因此，我们寻找可能在B组中高表达但在A组中低表达的基因簇。鉴定这组基因是有用的，因为这些基因可以解释对压力的生物反应。

但事实证明这两组不是线性可分的 - PCA在A组和B组中表现出很大的差异.A组中的一些个体聚集在B组中。有些基因在组中被上调B，但A组中的一个或两个人也承担了这种上调。是否存在一种策略来查找A组中所有个体统一共享的属性，并且该组与B组中的所有个体不同，知道这两个组应该是不同。

Answer 1

这不是聚类分析。

您有两个类：治疗和控制

并且您想要识别那些有助于区分这两个类别的特征（基因）。

寻找有监督的特征选择方法，例如信息增益;并研究可解释的分类器，如决策树和随机森林，它们将帮助您识别最具辨别力的基因。