Question

我一直在我的Mac电脑上尝试以下命令，删除2行（包括包含图案的行和连续行）

   sed -i '' -e "s/.*GAII02_0001:1:15:14342:18862#0/1.*/ , +1d"  output.fa new.fa

但我收到以下错误：

`sed: 1: "s/.*GAII02_0001:1:15:14 ...": bad flag in substitute command: ','`

示例输入：

GAII02_0001：1：94：1703：4111＃0/1 ATTTAGGGATTTAAGGATTAAGGATTAAGGATCCAGAGATTTAGGGATTTA GAII02_0001：1：15：14342：18862＃0/1 TTAGAGATTTAGGGATTTAGGGATATAGGGATTTAGTGATTTAGGGATTTA GAII02_0001：1：7：12506：5001＃0/1 AATCCCTAAATCTCTGGATCCTTAATCCTTAATCCTTAAATCCCTAAATCC

示例输出：

GAII02_0001：1：94：1703：4111＃0/1 ATTTAGGGATTTAAGGATTAAGGATTAAGGATCCAGAGATTTAGGGATTTA GAII02_0001：1：7：12506：5001＃0/1 AATCCCTAAATCTCTGGATCCTTAATCCTTAATCCTTAAATCCCTAAATCC

Answer 1

您可以使用

 sed '/GAII02_0001:1:15:14342:18862#0\/1/{N;d;}' foo.txt

这将为您提供所需的输出

GAII02_0001:1:94:1703:4111#0/1
ATTTAGGGATTTAAGGATTAAGGATTAAGGATCCAGAGATTTAGGGATTTA
GAII02_0001:1:7:12506:5001#0/1
AATCCCTAAATCTCTGGATCCTTAATCCTTAATCCTTAAATCCCTAAATCC

这样做是使用N将下一行附加到模式空间，然后使用d删除这两行。

Answer 2

如果您在比赛后阅读下一行

，则可以删除两行

另请注意，我已经转义搜索字符串中的/，否则会终止表达式。

而且你输入了它作为替换，它只是一个匹配器

$ sed -e "/.*GAII02_0001:1:15:14342:18862#0\/1.*/{N;d;}" testfile
GAII02_0001:1:94:1703:4111#0/1
ATTTAGGGATTTAAGGATTAAGGATTAAGGATCCAGAGATTTAGGGATTTA
GAII02_0001:1:7:12506:5001#0/1
AATCCCTAAATCTCTGGATCCTTAATCCTTAATCCTTAAATCCCTAAATCC

Answer 3

试试这个：

sed -i.bak '/GAII02_0001:1:15:14342:18862#0\/1./,+1d' file

由＆＃39; /＆＃39;引起的错误在模式中。逃避它将是工作..

-i.bak将使用新文件file.bak备份您的文件。关心元数据~~

不要介意我的英语。（：

模式匹配后删除1行的Sed命令（显示错误：替换命令中的错误标志：'，'）

3 个答案: