ggparcoord:使用离散比例的颜色

时间:2016-01-13 14:50:02

标签: r ggplot2 scale ggally

我似乎无法使用离散比例将我的ggparcoord绘图着色。当我这样做时:

ggparcoord(data = iris, columns = 1:4, groupColumn = "Species")

输出图仍然使用连续刻度(使用Species因子的级别)对线条着色。

enter image description here

我还尝试了此处指定的scale_color_manual技巧的修改版本:controlling color in ggparcoord,但无济于事。

ggparcoord(data = iris, columns = 1:4, groupColumn = "Species") + 
    scale_color_manual(values = c("setosa" = "red", 
                                  "versicolor" = "green", 
                                  "virginica" = "blue"))

但我收到此错误消息:Error: Continuous value supplied to discrete scale

我也尝试了.. + scale_color_discrete():同样的错误信息。

我很难过......即使ggparcorod cran page上的例子也无效:

data(diamonds, package="ggplot2")
diamonds.samp <- diamonds[sample(1:dim(diamonds)[1],100),]
ggparcoord(data = diamonds.samp,columns = c(1,5:10),groupColumn = 2)

错误讯息:Error: (list) object cannot be coerced to type 'double'

修改

有一个解决方案是使用mapping=aes(color=as.factor(Species)),如下面的Didzis Elferts'回答所示。但是,它需要在scale_color_discrete

中添加一些其他自定义项
ggparcoord(data = iris, columns = 1:4, mapping=aes(color=as.factor(Species))) +
        scale_color_discrete("Species", labels=levels(iris$Species) )

是否有一种方法可以完成同样的事情,而需要添加scale_color_discrete("Species", labels=levels(iris$Species) )部分

enter image description here

例如,在ggplot2

ggplot(data=iris, aes(x=Sepal.Width,y=Sepal.Length,color=Species)) + geom_point()

自动生成标记清晰的图例。 ggparcoord中有类似的方法吗?

我使用的是R版本3.2.1,ggplot2_2.0.0GGally_1.0.0

sessionInfo()
# R version 3.2.1 (2015-06-18)
# Platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit)
# Running under: OS X 10.10.5 (Yosemite)
# 
# locale:
# [1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8
# 
# attached base packages:
# [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     
# 
# other attached packages:
# [1] ggplot2_2.0.0 GGally_1.0.0  magrittr_1.5  dplyr_0.4.3  

非常感谢任何帮助!

1 个答案:

答案 0 :(得分:7)

一种解决方案是使用参数mapping=并将其设置为as.factor(Species)(没有as.factor()它会给出与问题相同的结果)。然后使用scale_color_discrete(),您可以将Species个名称作为标签。

ggparcoord(data = iris, columns = 1:4, mapping=aes(color=as.factor(Species)))+
  scale_color_discrete("Species",labels=levels(iris$Species))

enter image description here