我正在使用HPC服务器运行R分析,尝试以大约9 GB的速度上传以前保存的R数据文件。
lnames <- load("LD.sixPop.RData")
Error: cannot allocate vector of size 4.7 Gb
Execution halted
Warning message:
system call failed: Cannot allocate memory
我运行该作业的节点有32CPU和256GB RAM。 R怎么会抱怨内存问题?我尝试用gc()清理垃圾,但它没有解决问题。 另一个问题是:每当我尝试在终端中打开R时,即使没有命令&#34; load&#34;它也很难恢复保存的RData。当它在头节点运行时,我必须取消它以便不占用太多内存。
R sessionInfo()输出如下:
sessionInfo()
R version 3.1.2 (2014-10-31)
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)
欢迎任何建议。