如何使用ggplot2和晶格在直方图上叠加分布曲线

时间:2010-08-11 15:12:47

标签: r ggplot2 lattice

说,我在ggplot2中使用facet_grid()来获得2个直方图。现在我想用泊松曲线(对2个直方图/网格有不同的平均值)和另一个分布的第二条曲线(我想手动提供值的概率函数)叠加这些直方图。如何才能做到这一点?

构建一个例子:

library(ggplot2)

value<-c(rpois(500,1.5))

group<-rep(c("A","B"),250)

data<-data.frame(value,group)

g1<-ggplot(data,aes(value))

g1+geom_histogram(aes(y=..count..),binwidth=1,position="identity")+facet_grid(.~group)

下一步是什么?

或者,可以使用晶格包完成吗?

2 个答案:

答案 0 :(得分:6)

简单的方法是绘制密度而不是计数,并使用stat_function()

library(ggplot2)
value<-c(rpois(500,1.5))
group<-rep(c("A","B"),250)
data<-data.frame(value,group)
ggplot(data,aes(value)) + 
        geom_histogram(aes(y=..density..), binwidth=1,position="identity") + 
        facet_grid(.~group) + 
        stat_function(geom = "line", fun = dpois, arg = list(lambda = 1.5), colour = "red", fill = NA, n = 9)

如果你想要计数,那么你需要将dpois的密度转换为'计数'

ggplot(data,aes(value)) + 
        geom_histogram(aes(y=..count..), binwidth=1,position="identity") + 
        facet_grid(.~group) + 
        stat_function(geom = "line", fun = function(..., total){dpois(...) * total}, arg = list(lambda = 1.5, total = 250), colour = "red", fill = NA, n = 9)

答案 1 :(得分:2)

当最近遇到类似的问题(比较发行版)时,我写了一些transparent overlapping histograms的代码,可能会给你一些关于从哪里开始的想法。