我在将数据正确地导入ELKI以运行光学算法时遇到了一些麻烦，但是使用光学的R实现，我可以轻松获得可达性距离列表。我可以把它们写成这样的文件。 （指数，距离）
1 Inf
2 0.5
3 0.9 ...
我想找到由本地最小值分隔的集群。我认为ELKI软件中的Optics Xi算法可以做到这一点，但由于我在导入数据时遇到问题，我无法使用它。
使用Optics论文中的伪代码以另一种语言编写Optics集群提取算法会更容易吗？我认为从最基本的角度来看，当它们彼此相邻时，只是将指数聚集在一起，并且没有减少到新的局部最小值。
由于
答案 0 :(得分：2)
您可以尝试实现接口OPTICSTypeAlgorithm，这主要意味着读取数据并将其存储在ClusterOrder类型的对象中。
然而，ELKI包含一个略高级的OPTICS版本，可以用OPTICSXi产生更好的效果。详细信息最终将作为技术报告发布。您从R实现获得的数据不足以纠正OPTICS图中的一些常见工件。
请使用ELKI中的OPTICS版本。尝试覆盖树索引（这是非常快速和易于使用）。避免在输入数据中使用ID列，或告诉解析器哪一列是ID列。