Question

我在R版本3.2.2中拟合了一个Boosted回归模型，我的所有变量都是数字，但由于这个错误我无法继续＃34;总错误.deviance / n.cases：non - 二元运算符的数字参数＆＃34;。我的数据结构如下：

 str(uffe.data)
'data.frame':   1437 obs. of  7 variables:
 $ uffespeed  : num  0.162 0.298 0.317 0.261 0.759 ...
 $ uffepike   : num  0.419 0.419 0.419 0.419 0.419 ...
 $ uffeslope  : num  1.863 2.374 1.647 2.003 0.737 ...
 $ uffepop0999: num  15.6 15.6 15.6 15.6 15.6 ...
 $ uffedwater : num  359 2778 3112 2310 2726 ...
 $ uffedtown  : num  14139 11713 11330 12020 11654 ...
 $ ufferoads  : num  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...

我的模特是：

   uffebrt <- gbm.step(data=uffe.data, gbm.x = 2:7, 
     gbm.y = 1, family =      "gamma", tree.complexity = 5, 
     learning.rate = 0.01,bag.fraction = 0.5)

执行过早结束如下：

Length  Class   Mode 
     0   NULL   NULL 

GBM STEP - version 2.9 


Performing cross-validation optimisation of a boosted regression tree model 
for uffespeed with dataframe uffe.data and using a family of gamma 

Using 1437 observations and 6 predictors 

Error in total.deviance/n.cases : non-numeric argument to binary operator

我哪里错了？

Answer 1

gbm.step包中的dismo功能允许family成为：'bernoulli'，'binomial'，'poisson'，{{1}之一}，或'laplace'。如果您提供的家庭不是其中之一，则由'gaussian'调用的calc.deviance会引发以下错误：

gbm.step

您的错误消息表明Error in calc.deviance(y_i, u_i, weights = site.weights, family = family, : unknown family, should be one of: "binomial", "bernoulli", "poisson", "laplace", "gaussian"未按预期抛出该错误，因为calc.deviance（在您的错误消息中引用）在调用{{1}后（直接）出现} total.deviance/n.cases的来源。

该错误导致calc.deviance或gbm.step中的一个或另一个是非数字的。从查看来源我们可以安全地假设它不是total.deviance ,.这会留下n.cases，这是n.cases调用的结果。我的猜测是，出于某种原因，total.deviance正在为calc.deviance分配一个字符串。

我无法解释为什么会发生这种情况，但是根据您的意见，我怀疑使用其中一个接受的家庭将解决您的问题。你在新的R会话中得到错误吗？也许如果您从CRAN重新安装calc.deviance，它可能会按预期运行。

为了将来参考，total.deviance函数对于探索这些问题非常有用，因为它允许您逐步浏览源，检查在任何点创建的对象。

作为旁注，打印到屏幕上的信息错误地表明可能支持gamma系列，因为它显示：

dismo

但请考虑以下提供的debug以及随后的消息：

## Performing cross-validation optimisation of a boosted regression tree model 
## for uffespeed with dataframe uffe.data and using a family of gamma

在执行错误检查之前打印消息，这有点误导。但至少在我的情况下，我也看到了：

family

＆＃34;错误＆＃34; ...二元运算符＆＃34;的非数字参数，但所有变量都是数字

1 个答案: