使用knitr时，我可以在子Rnw文档之间交换数据吗？

Question

父文件如下：

<<child = "child1.Rnw">>=
@
<<child = "child2.Rnw">>=
@

孩子1：

<<>>=
set_parent("parent.Rnw")
x <- 1
@

孩子2：

<<>>=
set_parent("parent.Rnw")
x
@

我可以运行父文档。但是，我不能单独运行子2文档。似乎子2文档无法看到在子1文档中定义的变量x。如何单独运行子2文档？

Answer 1

set_parent并不像您期望的那样工作。来自?set_parent：

  

此函数提取父文档的LaTeX前导码以用于子文档，以便可以将子文档编译为单个文档。

set_parent("parent.Rnw")赢得knit整个父文档，它只提取序言。因此，使用此parent.Rnw文件

\documentclass{article}
\begin{document}

<<child = "child1.Rnw">>=
@

<<child = "child2.Rnw">>=
@

\end{document}

child2.Rnw无法单独编译，因为在这种情况下未运行child1.Rnw。

以下 ¹ ：

的作用是什么

knit("parent.Rnw")
knit("child2.Rnw")

由于两个文档都在同一环境中进行评估（请参阅knit的默认envir值），因此来自parent.Rnw（以及它的孩子）的对象可以用于child2.Rnw的后续编织。

此外，?set_parent提供了另一种选择：

  

当父文档的前导码还包含代码块和内联R代码时，它们将被评估为好像它们在此子文档中一样。

如果可以重新排列parent.Rnw，以便引用child1.Rnw的块在序言中

\documentclass{article}

<<child = "child1.Rnw">>=
@

\begin{document}

<<child = "child2.Rnw">>=
@

\end{document}

然后可以编织child2.Rnw而无需事先编织parent.Rnw。

^{1 出于某种原因，knit2pdf("child2.Rnw")在我的系统上崩溃pdflatex.exe（通过texify.exe调用）。但是，PDF文件已正确生成，并且直接在TEX文件上运行pdflatex不会造成任何麻烦。 Nevermind。功能}