seaborn中的clustermap标签？

Question

我对clustermap中seaborn的标签有几个问题。首先，可以提取层次聚类的距离值，并在树结构可视化上绘制值（可能只有前三个级别）。

以下是我创建群集图的示例代码：

import pandas as pd
import numpy as np
import seaborn as sns
get_ipython().magic(u'matplotlib inline')

m = np.random.rand(50, 50)
df = pd.DataFrame(m, columns=range(4123, 4173), index=range(4123, 4173))
sns.clustermap(df, metric="correlation")

另外两个问题是：   - 如何旋转y标签，因为它们重叠在一起   - 如何将颜色条移动到底部或右侧。 （热像图有question，但对我的情况不起作用。也没有解决颜色问题    吧位置）

Answer 1

我有一个完全相同的问题，y轴上的标签被旋转并找到了解决方案。 问题是，如果你plt.yticks(rotation=0)喜欢在你引用的问题中提出建议，那么由于ClusterGrid的工作方式，它会轮换你的公鸡上的标签。

要解决此问题并旋转正确的标签，您需要引用基础Axes中的Heatmap并旋转这些标签：

cg = sns.clustermap(df, metric="correlation")
plt.setp(cg.ax_heatmap.yaxis.get_majorticklabels(), rotation=0)

关于彩条位置的其他问题，我不认为目前支持这一点，遗憾的是this Github issue所示。

最后，对于层次聚类距离值，您可以使用以下命令访问行或列的链接指标：

cg = sns.clustermap(df, metric="correlation")
cg.dendrogram_col.linkage # linkage matrix for columns
cg.dendrogram_row.linkage # linkage matrix for rows

Answer 2

import seaborn as sns   
g = sns.clustermap(heatmap_df, metric="correlation") 

plt.setp(g.ax_heatmap.get_yticklabels(), rotation=0)  # For y axis
plt.setp(g.ax_heatmap.get_xticklabels(), rotation=90) # For x axis

Answer 3

你可以通过改变它的轴 cax 的位置来移动颜色条： 例如cg.cax.set_position((.85,.1,.1,.1))，其中（a，b，c，d）分别是轴坐标的x起始位置，y起始位置，x宽度和y高度。

Answer 4

旋转标签的方式有点不同

g.ax_heatmap.set_yticklabels(g.ax_heatmap.get_yticklabels(), rotation=0)