从空图

Question

我正在创建一个关联的圆形图，我想绘制两种类型的信息：

1. 两轴中从-1到1的圆圈
2. 添加第一个组件和第二个组件与箭头不同的那些相关性
3. 将具有第一或第二分量等于0
的相关性添加为点

用于绘制每个箭头/点的颜色集成在data.all all：

中
• 第1列：X轴
• 第2列：Y轴
• 第3栏：功能（颜色）

（更新）我的代码是：

## Colors for datasets
fColor <- c("yellow", "blue", "green", "red")
names(fColor) <- c("background", "isolation_p", "media", "solution")
## /

## Filters for 0s
f1 <- all[ , 1] != 0 & all[ , 2] != 0
f2 <- all[ , 1] == 0 | all[ , 2] == 0
## /

## Draw Circle
theta <- c(seq(-pi, pi, length = 50), seq(pi, -pi, length = 50))
circle <- data.frame(xcircle = cos(theta), ycircle = sin(theta))
p <- ggplot2::ggplot(data = circle, ggplot2::aes_string("xcircle", "ycircle")) +
  ggplot2::geom_path(ggplot2::aes_string("xcircle", "ycircle")) +
  ggplot2::geom_hline(yintercept = 0, linetype = "dashed") +
  ggplot2::geom_vline(xintercept = 0, linetype = "dashed")
## /

## Draw arrows
p <- p + ggplot2::geom_segment(data = all[f1, ],
   ggplot2::aes_string(x = 0, y = 0, xend = "x", yend = "y"),
   arrow = grid::arrow(length = grid::unit(0.2, "cm")),
   color = fColor[all$feature[f1]], linetype = "solid")
## /

## Draw points
p <- p + ggplot2::geom_point(data = all[f2, ],
   ggplot2::aes_string("x", "y"),
   color = fColor[all$feature[f2]], shape = 19, size = 2)
## /

## Add axis labels
p <- p + ggplot2::scale_y_continuous("First Component") +
  ggplot2::scale_x_continuous("Second Component")
## /

现在我想为图中使用的颜色添加图例，但我无法添加它。 ¿有些想法？

（更新）我想在传奇中看到的是解决方案的红色子弹，媒体的绿色子弹，背景的黄色子弹和背景的蓝色子弹（使用来自功能的标签，all的第3列）。

+信息

（更新）我all data.frame的片段：

all <- read.table(text = "x y   feature
yc01002711  -0.1755657  0.0000000000    background
yc02001111  0.0000000   -0.0006935916   background
yc03001287  0.0000000   -0.3966829792   background
yc04001667  0.0000000   -0.0575593341   background
xx00000091  -0.4205095  0.0000000000    isolation_p
xx00000092  0.0000000   -0.0085758016   isolation_p
sc78    0.03099176  -0.1425365  media
sc88    0.03897109  0.0000000   media
sc09    -0.05278946 0.0000000   media
inm10058    -0.05277376 0.0000000   solution
inm10099    -0.05286904 0.0000000   solution
inm10101    -0.08174610 -0.1315094  solution")

绘制情节的示例：

Answer 1

当我运行你的代码时，我没有得到你所展示的完全相同的数字，但是如果你运行这段代码，我得到的是我运行你的代码时得到的相同数字但你想要的传奇。

而不是在绘图之前使用aes_string（）I子集。

f2_s <- all[f2, ]
p <- p + geom_point(data = f2_s, aes(x, y, color=feature), shape = 19, size = 2)
p
p + scale_color_manual(values=c("yellow", "blue", "green", "red"))
p + scale_color_manual(values=c("yellow", "blue", "green", "red")) + scale_y_continuous("First Component") + scale_x_continuous("Second Component")