我在R中有一个脚本（由其他人编写），它使用带有'-batch'开关的shell（）调用ImageJ进行图像分析：
shell("C:\\ImageJ\\imagej.exe -batch [args]")
分析确实开始了，但似乎R在分析完成之前继续执行下一行，因此在创建之前尝试访问某些文件。
如果我使用调试器断点运行它，并等到它完成后再继续，一切正常。但是如果我尝试将它作为一个整体运行，我会因读取一个空文件夹而收到错误。
shell（）命令有一个可选的参数'wait'，默认值为“TRUE”，但我想启动ImageJ，而不是它的完成，被认为是shell的“完成”，这就是R继续的原因。 那么我该怎么做才能迫使R等到ImageJ完成？我知道我可以在while循环中检查已创建文件的数量，因此它几乎可以保留，直到创建所有文件。但我宁愿有一个更优雅，更危险的解决方案。 谢谢！