我正在尝试计算文本文件第3列中唯一出现的数字,这是一个非常简单的命令:
awk 'BEGIN {FS = "\t"}; {print $3}' bisulfite_seq_set0_v_set1.tsv | uniq -c
应该说像
1 10103
2 2093
3 109
但反而是废话,其中相同的数字被多次计算,例如
20 1
1 2
1 1
1 2
14 1
1 2
我也试过
awk 'BEGIN {FS = "\t"}; {print $3}' bisulfite_seq_set0_v_set1.tsv | sed -e 's/ //g' -e 's/\t//g' | uniq -c
我已尝试过uniq手册页中我能想到的所有组合。如何使用uniq?
正确计算数字的唯一出现次数答案 0 :(得分:5)
uniq -c
计算连续重复次数。要计算它们,您需要先对它进行排序。但是,使用awk
您不需要。
$ awk '{count[$3]++} END{for(c in count) print count[c], c}' file
会做
答案 1 :(得分:4)
awk
- cut
,sort
和uniq
的免费版本:
cut -f 3 bisulfite_seq_set0_v_set1.tsv | sort | uniq -c
uniq
对相邻的匹配行进行操作,因此必须先对输入进行排序。