Question

我对C ++很陌生，但我习惯用R语言编写代码。几周前，我开始将一个应用程序复制并重命名为文件对（.seq / .ab1）。 DNA测序仪分析的结果（手动重命名数百个将是实时浪费，特别是因为我们有新名称的列表）。

一切似乎都很好，但是新文件（复制的文件）在名称中出现了“特殊字符”（在文件类型之前），它看起来像一个空格，但它不是（我已经取代了它）带空格，文件正确打开）。删除后，该文件可以被其关联的应用程序选中，但是使用它时，该应用程序会触发该文件被破坏。

问题似乎来自与ostringstream :: str成员函数相关的代码，但老实说我不知道如何修复它。我想知道在我附加文件类型之前它是否没有插入空字符...

这是负责代码的一部分。它从2列csv文件中获取旧名称和新名称，数据以“;”分隔。原始数据和新的（重命名文件）数据保存在不同的目录中，这就是我需要在for循环中创建每个文件路径的字符串的原因。我打算稍后检查新旧文件内容，可能是使用memcmp。但首先我需要正确地重命名它们。

我在使用gcc 4.8.4作为编译器的Ubuntu 14.04（64位）计算机上。我已经原谅自己可能编码不好，英文不好，我不是母语人士（作家，实际上）。

    fNew.open(filename);
    std::ostringstream oldSeqName (std::ostringstream::ate);
    std::ostringstream newSeqName (std::ostringstream::ate);
    std::ostringstream oldAb1Name (std::ostringstream::ate);
    std::ostringstream newAb1Name (std::ostringstream::ate);

    std::fstream log;
    time_t now = time(0);

    for (std::string nOld, nNew; getline(fNew, nOld, ';') && getline(fNew, nNew); )
    {
        std::cout << "Old Name: " << nOld << " -> New Name: " << nNew << std::endl;

        // Keep a log of the name changes
        log.open("NameChangesLog.txt", std::fstream::out | std::fstream::app);
        log << ctime(&now) << " - " <<  "Old Name: " << nOld << " -> New Name: " << nNew << std::endl;
        log.close();

        // Create old seq files paths string
        oldSeqName.str(nOld);
        oldSeqName << ".seq";
        std::string osn = "./Seq/" + oldSeqName.str();

        // Create new seq files paths string
        newSeqName.str(nNew);
        newSeqName << ".seq";
        std::string nsn = "./renamed/" + newSeqName.str();

        std::ifstream ifseq(osn, std::ios::binary);
        std::ofstream ofseq(nsn, std::ios::binary);

        ofseq << ifseq.rdbuf();

        ifseq.close();
        ofseq.close();

        // Create old ab1 files paths string
        oldAb1Name.str(nOld);
        oldAb1Name << ".ab1";
        std::string oan = "./Seq/" + oldAb1Name.str();

        // Create new abq files paths string
        newAb1Name.str(nNew);
        newAb1Name << ".ab1";
        std::string nan = "./renamed/" + newAb1Name.str();

        std::ifstream ifab1(oan, std::ios::binary);
        std::ofstream ofab1(nan, std::ios::binary);

        ofab1 << ifab1.rdbuf();

        ifab1.close();
        ofab1.close();

    }

    fNew.close();

Answer 1

是否在Windows机器上准备了列表文件？在这种情况下，它将有DOS行结束（\r\n），并不适合Unix上的getline。您看到的角色可能是\r。确保在将列表文件提供给程序之前使用dos2unix实用程序

Answer 2

您可能忘记trim从getline返回的值，因此它们可能仍包含空格。应用程序可以抓住空白区域。

C ++ - 损坏的字符串

2 个答案: