Question

有没有办法收集bsub发布的作业的退出代码？

例如：bsub启动了一个脚本test.sh（test.sh包含一些彼此推出的二进制文件）。

std::string cmdLine = "bsub test.sh";
File *fp = popen(cmdLine.c_str());
int retcode = pclose(fp); // this returns exit code of bsub (not wanted in this scenario)

我正在寻找一种方法来获取由bsub启动的二进制文件的退出代码？

谢谢！

Answer 1

LSF是一个批处理调度系统，因此您作为客户端与它的交互是异步的：

使用bsub，bsub命令提交作业以进行日程安排马上回来
在后台列出项目，系统时间表和派遣你的工作

要查找实际工作负载的状态，我可以为您提供几个选项。

选项1

强制bsub同步行动。考虑到代码示例的当前状态，这可能是最简单的选项：基本上您所要做的就是给bsub -K选项。这导致命令在作业排队，调度和完成之前基本上不返回，然后命令将返回作业的退出代码，如下所示：

std::string cmdLine = "bsub -K test.sh";  // Use -K option
File *fp = popen(cmdLine.c_str());
int retcode = pclose(fp);  // this will now return the exit code of test.sh

选项2

有些网站不喜欢让用户出于各种原因使用-K选项。如果是这种情况，那么您需要使用bjobs命令在系统中查询作业状态。

基本上，在bsub返回后，您的代码将重复调用bjobs命令并解析输出以确定作业的退出状态。例如：

$ bjobs -o 'stat exit_code' 6308
STAT EXIT_CODE
DONE -

为我提供了退出状态列和作业ID 6308的退出代码（通过在提交作业时解析bsub的输出来获取作业ID）：

如果状态列为DONE，则表明您的工作已成功完成
如果状态列为EXIT，那么您的作业异常结束，您可以从EXIT_CODE列中获取退出代码
如果状态列为RUN或PEND，那么您的作业正在运行或等待分发，您的代码应该sleep()一段时间，然后尝试拨打bjobs试。

请注意，上面的示例bjobs输出使用-o选项来自定义输出以便于解析。这是一个相对较新的功能，如果你使用的是较旧版本的LSF，你必须在没有它的情况下做 - 可行，但需要更多参与。

退出bsub启动的作业代码

1 个答案: