如何使用stans integrate_ode x输入?

时间:2015-12-20 09:03:20

标签: ode stan

最近stan添加了integrate_ode方法。不幸的是,我能找到的唯一文件是stan reference manual(p.191ff)。我有一个需要一些驱动信号的模型。据我所知,参数x_rx_i应该用于此。

为了一个具体的例子,我假设我想从文档中实现以下更改的示例:

 real[] sho(real t,
               real[] y,
               real[] theta,
               real[] x_r,
               int[] x_i) {
      real dydt[2];
      real input_signal; // Change from here!!!
      input_signal <- how_to(t, x_r, x_i); 
      dydt[1] <- y[2] + input_signal; // Change to here!!!
      dydt[2] <- -y[1] - theta[1] * y[2];
      return dydt;
}

输入信号应该是输入的时间序列 - 让我说我提交input_signal_vector <- sin(t) + rnorm(T, sd=0.1)(它应该是ts中时间点的信号)我打算在input_signal中使用最接近的值。

我能想象的唯一方法是在x_r中连接tsinput_signal_vector,然后在此数组中搜索。但我无法想象这是意图使用这些参数。这也是非常低效的。

因此,如果有人能够证明这样的案件应该如何解决,我将非常感激。

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