我试图改变一个"大"将因子分解为R中的一组指标(即虚拟,二元,标志)变量:
FLN <- data.frame(nnet::class.ind(FinelineNumber))
其中FinelineNumber
是来自Kaggle.com当前沃尔玛竞赛的5000级因素(如果您想重现此错误,则数据是公开的。)
我一直收到这个看起来很有意思的警告:
In n * (unclass(cl) - 1L) : NAs produced by integer overflow
系统可用的内存基本上是无限的。我不确定问题是什么。
答案 0 :(得分:6)
nnet::class.ind
的源代码是:
function (cl) {
n <- length(cl)
cl <- as.factor(cl)
x <- matrix(0, n, length(levels(cl)))
x[(1L:n) + n * (unclass(cl) - 1L)] <- 1
dimnames(x) <- list(names(cl), levels(cl))
x
}
.Machine$integer.max
是2147483647.如果n*(nlevels - 1L)
大于此值,则会产生错误。解决n
:
imax <- .Machine$integer.max
nlevels <- 5000
imax/(nlevels-1L)
## [1] 429582.6
如果您有429583或更多行(对于数据挖掘上下文而言不是特别大),您将遇到此问题。如上所述,如果您的建模框架可以处理稀疏矩阵,那么您可以使用Matrix::sparse.model.matrix
(或Matrix::fac2sparse
)更好地 。或者,你必须重写class.ind
以避免这个瓶颈(即按行和列而不是绝对位置进行索引)[@joran注释上面的R通过双精度值索引大向量,所以你或许可以通过黑客攻击
x[(1:n) + n * (unclass(cl) - 1)] <- 1
可能会在这里或那里投下一个明确的as.numeric()
来迫使强制加倍......]
即使您能够完成此步骤,您最终也会获得5000 * 650000矩阵 - 看起来这将是12Gb。
print(650*object.size(matrix(1L,5000,1000)),units="Gb")
我想如果你有100Gb免费可以,那就好......