我正在运行可以使用多个线程的DNA对齐器。目前在计算机集群上做16次。有趣的是,我觉得增加线程数量甚至是ram空间的回报都会减少。我的基准测试是否证明了这一点?因为CPU时间<系统时间大幅度提高。换句话说,这是否意味着限制因素是存储等其他问题,因此在这一点上利用更多线程无济于事?我的目标是减少总运行时间。
谢谢你。 User Time = 1:06:03:35
System Time = 04:35:24
Wallclock Time = 08:24:50
CPU = 1:10:38:59