字符/数字的乘法可以更高效吗?

时间:2015-12-13 17:58:52

标签: c performance gcc

我有以下代码,根据一个非常大的系列计算总和。

系列char *a是一个char数组,只包含数字(0..9)。

我想问一下是否有可能让代码更快。它目前是分布式计算应用程序的瓶颈。

小型复制代码。不是实际的代码,而是更简化。

int top = 999999999;

char *a;
a = (char*) calloc(top+1, sizeof(char));

// ... fill a with initial values ...

for (int i=0; i<10; ++i) {
    unsigned long long int sum = 0;

    for (m = 1, k = top; m < k; ++m, --k) {
        // Here is the bottle neck!!
        sum += a[m]*a[k];
    }

    printf("%d\n", sum);

    // ... Add something at the end of a, and increase top ...
}

我已尝试过以下操作:

  1. 使用-O3(gcc编译器)优化代码。编译器行现在是:

    gcc -c -Wall -fopenmp -Wno-unused-function -O3 -std=c99 -g0 -march=native -pipe -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -m64 -fwhole-program -fprefetch-loop-arrays -funsafe-loop-optimizations -Wunsafe-loop-optimizations -fselective-scheduling -fselective-scheduling2 -fsel-sched-pipelining -fsel-sched-pipelining-outer-loops -fgcse-sm -fgcse-lm -fgcse-las -fmodulo-sched -fgcse-after-reload -fsee -DLIBDIVIDE_USE_SSE2 -DLIBDIVIDE_USE_SSE4_1 xxx.c -o xxx.o
    
  2. 使用GNU openMP将for循环拆分为多个核心

    unsigned long long int halfway = (top>>1) + 1; // = top/2 + 1
    // digits is defined as top+1
    
    #pragma omp parallel // firstprivate/*shared*/(a, digits, halfway)
    for (unsigned long long int m = 1; m < halfway; ++m) {
        sum += a[m] * a[digits-m];
    }
    

    结果:更快,更快,但需要更多核心,我仍然希望加快速度。

  3. 在乘法之前将a[m]投射到unsigned long long int

    sum += (unsigned long long int)a[m] * a[k];
    

    结果:性能提升很小。

  4. 使用乘法查找表,因为数组查找比实际乘法更快。

    sum += multiply_lookup[a[m]][a[k]]; // a[m]*a[k];
    

    结果:性能提升很小。

  5. 我试图找到一种减少操作的数学解决方案,但似乎没有什么可以通过数学方法进行优化。

  6. 我有以下优化建议:

    I have read浮点数的乘法(asm fmul)比整数的乘法(asm mul)快得多。只是将int更改为float并没有帮助 - 但我认为如果使用MMX或SSE指令集完成工作,或者如果工作由FPU完成,代码可能会变得更加高效。虽然我有一些汇编知识,但我对这些主题一无所知。

    但是,如果您有其他想法如何优化它,我很高兴听到它们。

    更新一些其他信息:

    • 每个循环后系列增长1个元素。
    • 当系列增长时,top会增加。
    • top达到数组限制时,a将使用realloc()增加100000字节。
    • 平台:Debian Linux Jessie x64,在Intel(R)Xeon(R)CPU X3440 @ 2.53GHz上

    其他题外话题:您是否知道此总和的数学名称,该系列的元素对从外部乘以内部?

3 个答案:

答案 0 :(得分:7)

您可以使用鲜为人知的PMADDUBSW(Multiply和Add Packed Signed和Unsigned Bytes)。签名/未签名的业务在这里无关紧要,无论如何,一切都在[0 .. 9]的区间内。添加是饱和的,但这并不重要,因为9 * 9只有81.内在函数是_mm_maddubs_epi16。因为k索引关闭了,所以你必须对它进行字节反转,这可以用PSHUFB(_mm_shuffle_epi8)来完成。当索引在中间“相遇”时会发生令人讨厌的事情,你可以逐一完成这一部分。

这是一次尝试,只有轻微测试:

__m128i sum = _mm_setzero_si128();
int m, k;
for (m = 1, k = top - 15; m + 15 < k; m += 16, k -= 16) {
   __m128i am = _mm_loadu_si128((__m128i*)(a + m));
   __m128i ak = _mm_loadu_si128((__m128i*)(a + k));
   ak = _mm_shuffle_epi8(ak, _mm_set_epi8(0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 ,15));
   sum = _mm_add_epi16(sum, _mm_maddubs_epi16(am, ak));
}
// could use phaddw, but I do this the long way to avoid overflow slightly longer
sum = _mm_add_epi32(_mm_unpacklo_epi16(sum, _mm_setzero_si128()),
                    _mm_unpackhi_epi16(sum, _mm_setzero_si128()));
sum = _mm_hadd_epi32(sum, sum);
sum = _mm_hadd_epi32(sum, sum);
int s = _mm_cvtsi128_si32(sum);
// this is for the "tail"
k += 15;
for (; m < k; ++m, --k)
    s += a[m] * a[k];

我也忽略了溢出。您可以为(2 16 -1)/(2 * 81)= 404迭代执行此操作,但仍然绝对没有溢出。如果您需要更多,请定期将其添加到32位结果。

在快速基准测试中,这个速度大约是简单方法的7倍(在4770K上使用2KB随机数据进行测试,在每次运行中获得最佳运行效果)。

使用其他答案建议的指针可以进一步提高它的速度,大约是简单方法的9倍。有了索引,有一些奇怪的符号扩展正在进行。

int foobar(char* a, int top)
{
    __m128i sum = _mm_setzero_si128();

    char *m, *k;
    for (m = a + 1, k = a + top - 15; m + 15 < k; m += 16, k -= 16) {
       __m128i am = _mm_loadu_si128((__m128i*)(m));
       __m128i ak = _mm_loadu_si128((__m128i*)(k));
       ak = _mm_shuffle_epi8(ak, _mm_set_epi8(0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15));
       sum = _mm_add_epi16(sum, _mm_maddubs_epi16(am, ak));
    }

    sum = _mm_add_epi32(_mm_unpacklo_epi16(sum, _mm_setzero_si128()),
                        _mm_unpackhi_epi16(sum, _mm_setzero_si128()));
    sum = _mm_hadd_epi32(sum, sum);
    sum = _mm_hadd_epi32(sum, sum);
    int s = _mm_cvtsi128_si32(sum);

    k += 15;
    for (; m < k; ++m, --k)
        s += *m * *k;

    return s;
}

分成几部分,尽管有额外的逻辑,仍然是原版的9倍:

int foobar(char* a, int top)
{
    int s = 0;
    char *m, *k;
    for (m = a + 1, k = a + top - 15; m + 15 < k;) {
        __m128i sum = _mm_setzero_si128();
        for (int i = 0; i < 404 && m + 15 < k; m += 16, k -= 16, ++i) {
           __m128i am = _mm_loadu_si128((__m128i*)(m));
           __m128i ak = _mm_loadu_si128((__m128i*)(k));
           ak = _mm_shuffle_epi8(ak, _mm_set_epi8(0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 ,15));
           sum = _mm_add_epi16(sum, _mm_maddubs_epi16(am, ak));
        }
        sum = _mm_add_epi32(_mm_unpacklo_epi16(sum, _mm_setzero_si128()),
                            _mm_unpackhi_epi16(sum, _mm_setzero_si128()));
        sum = _mm_hadd_epi32(sum, sum);
        sum = _mm_hadd_epi32(sum, sum);
        s += _mm_cvtsi128_si32(sum);
    }

    k += 15;
    for (; m < k; ++m, --k)
        s += *m * *k;

    return s;
}

答案 1 :(得分:3)

这个循环,

for (m = 1, k = top; m < k; ++m, --k) {
    // Here is the bottle neck!!
    sum += a[m]*a[k];
}

可以从改为:

获益
char *b = a + top;
a++;
for (; a < b; ) 
{
    sum += ( *a++ ) * ( *b--);
}

通过删除[],您可以为每次访问数组保存很多算术运算。这使理论上的地址计算数减半: 4与++m --ka[m] a[k]相对应 2 *a++ *b--

简单的指针增量更便宜,而且总体来说通常更快,因为数组访问并不总是使用[]完美优化。

希望这有帮助

答案 2 :(得分:2)

您要执行的操作称为discrete convolution,它会在乘以大数字时出现。您使用的天真算法的复杂度为O( n 2 ),但是O( n log n )使用discrete Fourier transform获得解决方案。

离散卷积

两个序列的离散卷积 c = a * b a = a 0 a 1 ,..., a n - 1 b = b 0 b 1 ,... , b n - 1 n 元素各自是2 的序列 - 为每个 k 定义了1个元素作为总和:

  

c i max(0, i - n + 1)≤ j &lt; min( n i + 1) a j < em> b i - j

如果我们假设 a i = b i = 0 i ∉{0,..., n - 1},然后我们可以简化这一点并求和所有整数 i

  

c i j a j b i - j

请注意这是您要执行的操作: a = b = a[]以及循环的i次迭代,sum只是 c i

离散卷积经过充分研究,并出现在与信号处理,组合和统计相关的许多数学问题中。幸运的是,它可以在超线性时间O( n log n )中计算,而不是天真的O( n 2 )。

循环离散卷积

我们可以将 b 扩展为 b N ,以便

  

b k = b k mod ñ,或
   b N = b 0 b < sub> 1
,..., b n - 1 b 0 ,..., b n - 1 b 0 ,... < /子>

这称为 b b N 循环扩展。离散卷积 a * b N 称为离散循环卷积 em> a 和 b

请注意, a b 的非循环离散卷积可以通过在 a 中附加足够多的零来计算循环卷积。和 b 在进行卷积之前, b 的循环扩展不会改变结果。有关详细信息,请参阅this article

离散傅立叶变换

离散傅里叶变换(DFT)将一系列样本 a 转换为采样信号的复频谱ℱ( a )。傅立叶变换是可逆的,并且可以使用各种fast Fourier transform(FFT)算法在超线性时间O( n log n )中进行计算。该变换在信号处理中具有许多应用。它具有有用的属性

  

a * b N =ℱ -1 (ℱ( a )×ℱ( b ))

也就是说,两个序列 a b 的循环卷积是傅立叶变换下的逐元素乘法。由于逐元素乘法可以在线性时间内完成,因此可以在总时间O( n log n )中计算所需的结果。

实施

FFTW项目提供高度优化的快速傅里叶变换实现。

问题

傅立叶变换处理复数,并且要求浮点单元快速。结果可能有点不精确。据我所知,精确的方法可能有一些模数魔法(这是Schönhage-Strassen算法中用于大整数乘法的方法)但我不确定细节。