计算numpy数组中列的出现次数

时间:2015-12-12 00:11:01

标签: python numpy

给定一个2 x维的numpy数组M,我想计算M的每一列的出现次数。也就是说,我正在寻找bincount的一般版本。

到目前为止我尝试过的方法:(1)将列转换为元组(2)将散列元组(通过hash)转换为使用numpy.bincount的自然数(3)。

这看起来很笨拙。有人知道更优雅高效的方式吗?

2 个答案:

答案 0 :(得分:4)

您可以使用collections.Counter

>>> import numpy as np
>>> a = np.array([[ 0,  1,  2,  4,  5,  1,  2,  3],
...               [ 4,  5,  6,  8,  9,  5,  6,  7],
...               [ 8,  9, 10, 12, 13,  9, 10, 11]])
>>> from collections import Counter
>>> Counter(map(tuple, a.T))
Counter({(2, 6, 10): 2, (1, 5, 9): 2, (4, 8, 12): 1, (5, 9, 13): 1, (3, 7, 11):
1, (0, 4, 8): 1})

答案 1 :(得分:2)

假设:

a = np.array([[ 0,  1,  2,  4,  5,  1,  2,  3],
              [ 4,  5,  6,  8,  9,  5,  6,  7],
              [ 8,  9, 10, 12, 13,  9, 10, 11]])
b = np.transpose(a)
  1. 比散列更有效的解决方案(仍需要操作):

    我使用灵活的数据类型np.void(参见here)创建数组视图,使每行成为单个元素。转换为此形状将允许np.unique对其进行操作。

    %%timeit    
    c = np.ascontiguousarray(b).view(np.dtype((np.void, b.dtype.itemsize*b.shape[1])))
    _, index, counts = np.unique(c, return_index = True, return_counts = True)
    #counts are in the last column, remember original array is transposed
    >>>np.concatenate((b[idx], cnt[:, None]), axis = 1)
    array([[ 0,  4,  8,  1],
           [ 1,  5,  9,  2],
           [ 2,  6, 10,  2],
           [ 3,  7, 11,  1],
           [ 4,  8, 12,  1],
           [ 5,  9, 13,  1]])
    10000 loops, best of 3: 65.4 µs per loop
    

    附加到a

  2. 的唯一列的计数
  3. 您的哈希解决方案。

    %%timeit
    array_hash = [hash(tuple(row)) for row in b]
    uniq, index, counts = np.unique(array_hash, return_index= True, return_counts = True)
    np.concatenate((b[idx], cnt[:, None]), axis = 1)
    10000 loops, best of 3: 89.5 µs per loop
    
  4. 更新:Eph的解决方案是最有效和最优雅的。

    %%timeit
    Counter(map(tuple, a.T))
    10000 loops, best of 3: 38.3 µs per loop