R包安装在2个不同的位置

Question

我在两个位置安装了R包ape，它们是.libPath()的两部分 - 位置1中的ape版本3.3 - 位置2中的ape版本3.4

在ape版本3.4中的

，有一个新函数clustalomega。我没有加载任何2个包（使用library）

ape::clustalomega无法在我的计算机上运行。我怀疑这是因为R首先考虑了它在location1中发现的ape旧版本。

我试图使用.libPath(rev(.libPath())来反转libPath的顺序，但它没有改变任何内容。

有没有办法确保我们从位置2优先获取包（我无法控制location1上安装的内容）

Answer 1

解决方案在于功能unloadNamespace。似乎当R启动时，尽管它没有加载library("ape")，它仍然会加载包的命名空间，从它可以找到的第一个lib.loc（在本例中为location1）

因此，为了强制从其他位置加载命名空间，我们需要这样做：

  

ape :: clustalomega＃不存在
  “ape”％in％loadedNamespaces（）#returns TRUE
   unloadNamespace（ns ='ape'）'ape'％in loadedloadedNamespaces（）#returns FALSE   loadNamespace（package ='ape'，lib.loc = location2）

     

ape :: clustalomega＃现在有效