我正在收集来自各种文件的时间索引数据,但有时会有一些重叠:
df1 = pd.DataFrame([1, -1, -3], columns=['A'], index=pd.date_range('2000-01-01', periods=3))
df2 = pd.DataFrame([-3, 10, 1], columns=['A'], index=pd.date_range('2000-01-03', periods=3))
pd.concat([df1, df2])
A
2000-01-01 1
2000-01-02 -1
2000-01-03 -3
A
2000-01-03 -3
2000-01-04 10
2000-01-05 1
A
2000-01-01 1
2000-01-02 -1
2000-01-03 -3
2000-01-03 -3
2000-01-04 10
2000-01-05 1
1)如何清理和删除重复的行?(此处为2000-01-03)
2)更一般地说,使用pandas
读取和合并多个csv文件比使用手动更快/更聪明的方式:
L=[]
for f in glob.glob('*.csv'):
L.append(pd.read_csv(f, ...))
fulldata = pd.concat(L) # this can be time consuming
fulldata.remove_duplicate_lines() # this can be time consuming too
答案 0 :(得分:2)
IIUC你可以做pd.concat
然后做drop_duplicates
:
In [104]: pd.concat([df1, df2]).drop_duplicates()
Out[104]:
A
2000-01-01 1
2000-01-02 -1
2000-01-03 -3
2000-01-04 10
2000-01-05 7
修改强>
你是对的,这种方法不能正常工作,因为它按值而不是按索引下降。对于索引,index
可以duplicated
:
df = pd.concat([df1, df2])
df[~df.index.duplicated()]
In [107]: df[~df.index.duplicated()]
Out[107]:
A
2000-01-01 1
2000-01-02 -1
2000-01-03 -3
2000-01-04 10
2000-01-05 1
或者您可以使用第一种方法进行修改,首先需要执行reset_index
,然后使用drop_duplicates
,但使用subset
键的索引值:
pd.concat([df1, df2]).reset_index().drop_duplicates(subset='index').set_index('index')
In [118]: pd.concat([df1, df2]).reset_index().drop_duplicates(subset='index').set_index('index')
Out[118]:
A
index
2000-01-01 1
2000-01-02 -1
2000-01-03 -3
2000-01-04 10
2000-01-05 1
答案 1 :(得分:2)
如果你喜欢冒险并且决定使用除了Pandas以外的东西来组合CSV,和你在使用Awk的机器上,你可以组合各种文件并删除重复项用这个命令:
awk '!arr[$0]++' /path/to/your/files/* > combined_no_dups.csv
然后你可以加载到熊猫......
df = pd.read_csv("combined_no_dups.csv")