Question

我有两个时间序列数据，我正在进行动态时间扭曲（DTW）分析。我用R中的“zoo”函数创建了这两个系列：ZooData：Zoon系列从1.93到547.211; ZooData2：动物园系列从1.207到2190.516。 ZooData2是我的参考系列，ZooData是我的测试系列。根据该论文：“不对称步骤模式将时间扩展限制为两倍;不可能将查询与参考完全对齐超过两倍。”所以，我不能使用step.pattern=asymmetric这里，我应该选择哪种步骤模式？该文件建议我选择Rabiner-Juang IV型：

alignment<-dtw(zooData,zooData2,step.pattern =rabinerJuangStepPattern(4,"c"))

但我在R中试过，它没有用：

Error in dtw(zooData, zooData2, step.pattern = rabinerJuangStepPattern(4,  : 
  No warping path exists that is allowed by costraints

任何人都可以帮助我吗？另外，我想做KNN分析，所以我想使用非对称步骤模式，而不是对称步骤模式。非常感谢你！

Answer 1

distance<-read.csv(file.choose(), head=T, row.names=1)

我是R的新手，在我发布这个问题之前，我知道函数read.csv，但我不知道如何编写路径，例如，如果我将文件放在桌面上，我该怎么办？从C：//桌面读取它。然后我找到了代码file.choose()，您可以直接单击要导入的文件。

然后，我需要我的第一列也是变量名，这里是row.names的描述：

行名称向量。这可以是给出实际行名称的向量，或者是给出包含行名称的表的列的单个数字，或者是给出包含行名称的表列名称的字符串。

如果存在标题且第一行包含的字段少于列数，则输入中的第一列用于行名称。否则，如果缺少row.names，则对行进行编号。

使用row.names = NULL强制进行行编号。缺少或NULL row.names生成被认为是“自动”的行名（并且不会被as.matrix保留）。

Answer 2

将第一列设置为行名。

read.csv("yourfile.csv", head=T, row.names=1)

我应该在R中选择哪种DTW步骤模式？

2 个答案: