Question

有没有办法让rJava打印出错误的完整堆栈跟踪，而不仅仅是异常？例如，此代码（尝试从R调用Ambit2 cheminformatics库）

smrkMan <- .jnew("ambit2.smarts.SMIRKSManager", dcob)
reaction <- .jcall(smrkMan, "Lambit2/smarts/SMIRKSReaction;", "parse", ">>C" )
res <-  .jcall(smrkMan, "Z", "applyTransformation", AC, 
             .jnull("ambit2/smarts/IAcceptable"),
             reaction)

只给我

Fehler in .jcall(smrkMan, "Z", "applyTransformation", AC,
.jnull("ambit2/smarts/IAcceptable"),  : 
java.lang.NullPointerException

这不是非常有用，我想看看它失败了哪一行所以我可以回去并在源代码中追踪它......

有可能吗？

Answer 1

您可以使用.jgetEx()来获取异常对象并打印堆栈跟踪：

> .jcall("C",,"main",check=FALSE)
> ex=.jgetEx()
> .jcheck()
Error: java.lang.Exception: foo
> ex$printStackTrace()
java.lang.Exception: foo
    at C.main(C.java:3)

与

public class C {
  static void main() throws Exception {
  throw new Exception("foo"); } }

请确保在致电.jclear()之前致电.jcheck()或printStackTrace()，因为在您清除异常之前，Java不会做任何事情。

rJava：如何获得堆栈跟踪/更详细的错误？

1 个答案: