如何重复使用block_diag

时间:2015-12-06 19:57:17

标签: python-2.7 scipy sparse-matrix

我有一个相当简单的问题,但仍然无法使其发挥作用。 我想要一个块对角线n ^ 2 * n ^ 2矩阵。这些块是稀疏的n * n矩阵,只有对角线,首先是对角线,然后是对角线。对于n=4的简单情况,可以轻松完成

datanew = ones((5,n1))
datanew[2] = -2*datanew[2]
diagsn = [-4,-1,0,1,4]
DD2 = sparse.spdiags(datanew,diagsn,n,n)
new = sparse.block_diag([DD2,DD2,DD2,DD2])

由于这只对小n有用,有没有更好的方法来使用block_diag?关于n - >的思考1000

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

构建一长列DD2矩阵的简单方法是列表理解:

In [128]: sparse.block_diag([DD2 for _ in range(20)]).A
Out[128]: 
array([[-2,  1,  0, ...,  0,  0,  0],
       [ 1, -2,  1, ...,  0,  0,  0],
       [ 0,  1, -2, ...,  0,  0,  0],
       ..., 
       [ 0,  0,  0, ..., -2,  1,  0],
       [ 0,  0,  0, ...,  1, -2,  1],
       [ 0,  0,  0, ...,  0,  1, -2]])

In [129]: _.shape
Out[129]: (80, 80)

至少在我的版本中,block_diag想要一个数组列表,而不是*args

In [133]: sparse.block_diag(DD2,DD2,DD2,DD2)
...
TypeError: block_diag() takes at most 3 arguments (4 given)

In [134]: sparse.block_diag([DD2,DD2,DD2,DD2])
Out[134]: 
<16x16 sparse matrix of type '<type 'numpy.int32'>'
    with 40 stored elements in COOrdinate format>

这可能不是构建这种块对角线阵列的最快方法,但它是一个开始。

=====

查看sparse.block_mat的代码,我推断它确实如此:

In [145]: rows=[]
In [146]: for i in range(4):
    arow=[None]*4
    arow[i]=DD2
    rows.append(arow)
   .....:     

In [147]: rows
Out[147]: 
[[<4x4 sparse matrix of type '<type 'numpy.int32'>'
    with 10 stored elements (5 diagonals) in DIAgonal format>,
  None,
  None,
  None],
 [None,
  <4x4 sparse matrix of type '<type 'numpy.int32'>'
  ...
  None,
  <4x4 sparse matrix of type '<type 'numpy.int32'>'
    with 10 stored elements (5 diagonals) in DIAgonal format>]]

换句话说,rowsNone的'矩阵',沿着对角线有DD2。然后将它们传递给sparse.bmat

In [148]: sparse.bmat(rows)
Out[148]: 
<16x16 sparse matrix of type '<type 'numpy.int32'>'
    with 40 stored elements in COOrdinate format>

bmat反过来从所有输入矩阵的data,rows,cols格式收集coo,将它们连接到主数组,并从中构建新的coo矩阵。

另一种方法是直接构造这3个数组。