在paleotree包中使用multiDiv的问题

时间:2015-12-02 21:19:54

标签: r tree phylogeny

我正在尝试使用包paleotree来构建LTT图,但是当我尝试输入树时出现以下错误。

a=read.tree(file.choose()) # to choose newick/nexus file
multiDiv(a)

multiDiv(a)中的错误:未知类型的数据

paleotools只接受类' multiphylo' ?我将输入树转换为类multiphylo,但它仍然给出相同的错误。谁能建议怎么做呢?

1 个答案:

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我是包paleotree的作者。我认为这里发生的是你正在将一棵树传递给multiDiv,这是用于分析对象列表的设置,每个对象列表都转换为多样性曲线。您可能需要phyloDiv()。如果不了解您的数据,我无法确定。