当条件= TRUE

时间:2015-11-30 12:17:12

标签: r party

我正在尝试计算使用cforest包中的party函数构建的随机林的变量重要性。我想将条件设置为TRUE运行varimp,但是当我这样做时,我收到一条错误消息。错误如下:

  

if(node [[5]] [1] == variableID)cp< - node [[5]] [[3]]出错:   参数长度为零

使用默认设置conditional = FALSE运行Varimp效果很好。

关于数据集,所有变量都是分类的。响应变量是Glottal(是/否),有七个预测变量。这是数据的link,这是我正在使用的代码:

library(party)

glottal.df <-read.csv("~glottal_data.csv", header=T)

glottal.df$Instance <- factor(glottal.df$Instance)

data.controls <- cforest_unbiased(ntree = 500, mtry = 2)
set.seed(45)

glottal.cf <- cforest(Glottal ~ Stress + Boundary + Context + Instance + Region + Target + Speaker, data = glottal.df, controls = data.controls)

# this gives me an error
glottal.cf.varimp.true <- varimp(glottal.cf, conditional = TRUE)

# this works
glottal.cf.varimp.false <- varimp(glottal.cf)

有谁能告诉我为什么会收到此错误?这不是任何特定变量的问题,因为即使我删除变量,创建新林并尝试重新计算varimp,问题仍然存在,并且数据集中没有缺失值。非常感谢您的帮助!

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

似乎与第1.2.4方合作:


> glottal.cf.varimp.true
       Stress      Boundary       Context
 0.0003412322  0.2405971564  0.0122369668
     Instance        Region        Target
-0.0043507109  0.0044360190 -0.0011469194
      Speaker
 0.0384834123
> packageVersion('party')
[1] ‘1.2.4’
> R.version
               _
platform       x86_64-pc-linux-gnu
arch           x86_64
os             linux-gnu
system         x86_64, linux-gnu
status
major          3
minor          4.3
year           2017
month          11
day            30
svn rev        73796
language       R
version.string R version 3.4.3 (2017-11-30)
nickname       Kite-Eating Tree