Question

我试图创建一个带有函数＆＃39; plot＆＃39;然后使用heatmap.2（包＆＃39; gplots＆＃39;）绘制我的对象的内容。不幸的是，热图的树形图没有绘图，我得到以下错误：

Error in (function (classes, fdef, mtable)  : 
  unable to find an inherited method for function ‘plot’ for signature ‘"numeric"’
Error in (function (classes, fdef, mtable)  : 
  unable to find an inherited method for function ‘plot’ for signature ‘"numeric"’

这肯定会发生，因为在数字数据上有一个方法图的内部调用，大概是在绘制树形图时，R不能告诉我是否意味着我是从我调用的绘图函数或默认值。但是，我已经尝试通过如下声明我的绘图函数来避免这种情况：

##assign generic plot to plot.missing as the default function
##then create a plot for the current object (default has to be saved first!)
if (!exists("plot.missing")) plot.missing <- plot
setGeneric("plot", function(object, ...) standardGeneric("plot"));
setMethod("plot", "missing", function(object, ...) plot.missing());
##now it's safe to create a custom predict method

setMethod(f = "plot", 
          signature(object = "REFSEnsembleLite"),
          definition = function(object, type = 'significance', ...) {

我对S4没有期待，但我认为这样可以找到默认的绘图功能。

哦，是的，最后一个细节：heatmap.2在我的S4对象的绘图函数之外工作，所以我认为这肯定与我在一个名为＆＃的函数中调用的事实有关。 39;积＆＃39;

控制R中的S4功能分辨率

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