提取topGO数据对象

时间:2015-11-25 14:36:03

标签: r annotations ontology

我已经在R中成功创建了一个topGO数据对象。现在我想在矩阵中提取GO-ID,GO术语和包含的基因。 ann.genes 变量是一个字符向量列表,即

$`GO:0005524`
[1] "1432" "1956" "207"  "2534" "3320" "6714"

如何获取/提取“GO:00005524”ID名称并在topGO对象中找到相应的GO术语或从topGO数据库加载? 名称(ann.genes)适用于此处。现在如何获得GO术语?

非常感谢你。

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