我有兴趣使用scipy.integrate
库为给定的初始点积分矢量场(即找到流线)。由于矢量场是在计算网格上定义的numpy.ndarray
对象,因此必须对网格点之间的值进行插值。有没有集成商处理这个?也就是说,如果我要尝试以下
import numpy as np
import scipy.integrate as sc
vx = np.random.randn(10,10)
vy = np.random.randn(10,10)
def f(x,t):
return [vx[x[0],x[1]], vy[x[0],x[1]]] # which obviously does not work if x[i] is a float
p0 = (0.5,0.5)
dt = 0.1
t0 = 0
t1 = 1
t = np.arange(t0,t1+dt,dt)
sc.odeint(f,p0,t)
修改:
我需要返回周围网格点的矢量场的插值:
def f(x,t):
im1 = int(np.floor(x[0]))
ip1 = int(np.ceil(x[1]))
jm1 = int(np.floor(x[0]))
jp1 = int(np.ceil(x[1]))
if (im1 == ip1) and (jm1 == jp1):
return [vx[x[0],x[1]], vy[x[0],x[1]]]
else:
points = (im1,jm1),(ip1,jm1),(im1,jp1),(ip1,jp1)
values_x = vx[im1,jm1],vx[ip1,jm1],vx[im1,jp1],vx[ip1,jp1]
values_y = vy[im1,jm1],vy[ip1,jm1],vy[im1,jp1],vy[ip1,jp1]
return interpolated_values(points,values_x,values_y) # how ?
最后一个return语句只是一些伪代码。但这基本上就是我要找的东西。
修改:
scipy.interpolate.griddata功能似乎是要走的路。是否有可能将其纳入自己的功能?事情如下:
def f(x,t):
return [scipy.interpolate.griddata(x,vx),scipy.interpolate.griddata(x,vy)]
答案 0 :(得分:2)
我打算建议matplotlib.pyplot.streamplot
从版本1.5.0开始支持关键字参数events = ['A','B','A','A','B','B','A','A']
target = ['B', 'A', 'A']
size = len(target)
count = len([start for start in range(len(events) - size + 1)
if events[start:start + size] == target])
,但它不实用且非常不准确。
您的代码示例对我来说有点混乱:如果您有start_points
,vx
向量字段坐标,那么您应该有两个网格:vy
和x
。使用这些你确实可以使用y
来获得一个平滑的向量场来进行整合,但是当我尝试这样做时,这似乎会占用太多的内存。以下是基于scipy.interpolate.griddata
的类似解决方案:
scipy.interpolate.interp2d
请注意,我使集成网格更加密集以获得额外的精度,但在这种情况下它并没有太大变化。
结果:
在评论中的一些注释后,我重新审视了我原来基于import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import scipy.interpolate as interp
import scipy.integrate as integrate
#dummy input from the streamplot demo
y, x = np.mgrid[-3:3:100j, -3:3:100j]
vx = -1 - x**2 + y
vy = 1 + x - y**2
#dfun = lambda x,y: [interp.griddata((x,y),vx,np.array([[x,y]])), interp.griddata((x,y),vy,np.array([[x,y]]))]
dfunx = interp.interp2d(x[:],y[:],vx[:])
dfuny = interp.interp2d(x[:],y[:],vy[:])
dfun = lambda xy,t: [dfunx(xy[0],xy[1])[0], dfuny(xy[0],xy[1])[0]]
p0 = (0.5,0.5)
dt = 0.01
t0 = 0
t1 = 1
t = np.arange(t0,t1+dt,dt)
streamline=integrate.odeint(dfun,p0,t)
#plot it
plt.figure()
plt.plot(streamline[:,0],streamline[:,1])
plt.axis('equal')
mymask = (streamline[:,0].min()*0.9<=x) & (x<=streamline[:,0].max()*1.1) & (streamline[:,1].min()*0.9<=y) & (y<=streamline[:,1].max()*1.1)
plt.quiver(x[mymask],y[mymask],vx[mymask],vy[mymask])
plt.show()
的方法。这样做的原因是,虽然griddata
计算整个数据网格的插值,interp2d
只计算给定点的插值,所以在几个点的情况下,后者应该很多更快。
我修复了之前的griddata
尝试中的错误,并提出了
griddata
与xyarr = np.array(zip(x.flatten(),y.flatten()))
dfun = lambda p,t: [interp.griddata(xyarr,vx.flatten(),np.array([p]))[0], interp.griddata(xyarr,vy.flatten(),np.array([p]))[0]]
兼容。它计算odeint
给出的每个p
点的插值。此解决方案不会消耗过多的内存,但使用上述参数运行要花费更长的时间。这可能是由于odeint
中对dfun
进行了大量评估,远远超过了作为输入的100个时间点所显示的内容。
但是,生成的流线比使用odeint
获得的流线要平滑得多,即使两种方法都使用默认的interp2d
插值方法:
答案 1 :(得分:1)