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Question

我需要从 R 执行外部工具，并在该工具中发生处理错误（如果有）。我知道3个函数可以完成我的任务：

shell, system and system2.

试图测试那些，我看到了那个命令

shell("notepad")

打开记事本。据我所知，shell不允许检查错误（没有接口可以查看stderr）。

当我打电话

system("notepad")

或

system2("notepad")

R 冻结尝试制作这些命令。

致电

system("start notepad")

或

system2("start notepad")

返回警告

Warning message:
running command '"start notepad"' had status 127

Answer 1

改编@ DavidTseng的答案（抱歉没有足够的声誉来支持它）......

system("cmd.exe", input = "notepad")

在Windows中为我工作。

Answer 2

正如我在评论中提到的，R文档显示在Windows中system()函数不会启动单独的shell（如果需要）。这就是命令行命令与system()一起运行的原因，但需要单独窗口的记事本不会运行：

来自system()的{{3}}：

最重要的区别是，在类似Unix的系统上启动一个shell然后运行命令。在Windows上，命令直接运行 - 使用shell作为通过shell运行命令的接口（默认情况下是Windows shell cmd.exe，与POSIX shell有很多不同）。

Answer 3

system("bash -l", input = "notepad")

Answer 4

对于Windows用户错误：system(path("c:", "program files", "r", "anysoft.EXE")) 但有效：system(path("c:", shQuote("program files"), "r", "anysoft.EXE"))

Answer 5

我不确定是否有对R的更新，因为这个问题是在大约四年前提出的，但是system("\"C:\path\to\exe.exe\" args", intern = T)对我有用，并且会打开一个单独的子窗口并在Windows 10上运行+ R 3.6 + RStudio。

不使用'intern = T'会给我返回127，并且没有运行该过程。

Answer 6

我有同样的问题。安装过程中还有一个我没有做的额外步骤。

寻找“将Rtools放入PATH”

writeLines（'PATH =“ $ {RTOOLS40_HOME} \ usr \ bin; $ {PATH}”'，con =“〜/ .Renviron”）

Answer 7

你们使它变得如此复杂。我通过参考this answer解决了这个问题。问题出在PATH。在R中键入Sys.which('')，您将看不到任何内容。因此，您必须在CMD中设置路径，然后在R中使用Sys.setenv(PATH = '')来完成这项工作。