在Anaconda中安装Python模块的开发版本的最佳实践是什么?

时间:2015-11-10 18:08:53

标签: python git anaconda distutils conda

我在Mac上使用Anaconda python发行版。我想使用最新版本的matplotlib source code on Github,进行一些更改,看看它是如何运行的。但大多数时候我只想使用Anaconda Python附带的matplotlib的正常版本,所以我想要一种方便来回切换的方法。

matplotlib文档对branching and pull-request workflow有一个很好的描述,但我不清楚我是如何实际安装和使用matplotlib的开发版本的,这将保留我正在运行的Python实现。

我的猜测是我想要设置一个包含最新matplotlib版本及其依赖关系的环境,并在该环境和普通root环境之间切换。但是,当我使用python setup.py develop安装matplotlib的开发版本时,它似乎安装到两个环境中。

那么,从GitHub使用Python包的开发版本的最佳实践是什么?

1 个答案:

答案 0 :(得分:4)

正如您在问题中提到的,conda env能够为您想要处理的任何软件包的开发版本维护单独的Python环境。

我不太清楚为什么你发现python setup.py develop正在将matplotlib的dev版本安装到你的root环境中。 也许您创建了一个新环境,但在安装matplotlib的开发版本之前没有激活它?例如:

~$ conda create --name matplotlib-dev --clone root
Fetching package metadata: ....
src_prefix: '/home/alistair/anaconda'
dst_prefix: '/home/alistair/anaconda/envs/matplotlib-dev'
Packages: 165
Files: 32
Linking packages ...
[      COMPLETE      ]|#####################################################| 100%
#
# To activate this environment, use:
# $ source activate matplotlib-dev
#
# To deactivate this environment, use:
# $ source deactivate
#
~$ conda info --envs 
# conda environments:
#
matplotlib-dev           /home/alistair/anaconda/envs/matplotlib-dev
root                  *  /home/alistair/anaconda

此时我已经创建了一个matplotlib-dev环境,但我还没有激活它,所以安装任何新软件包仍然会修改我的root环境。

~$ source activate matplotlib-dev
discarding /home/alistair/anaconda/bin from PATH
prepending /home/alistair/anaconda/envs/matplotlib-dev/bin to PATH

(matplotlib-dev)~$ conda info --envs 
# conda environments:
#
matplotlib-dev        *  /home/alistair/anaconda/envs/matplotlib-dev
root                     /home/alistair/anaconda

在任何情况下,直接使用setuptools(例如python setup.py installpython setup.py develop)都是no longer recommendedmight not be supported by future versions of numpy etc.

首选方法是使用pip install <path>pip install -e <path>,如果您需要安装"editable"(类似于python setup.py develop提供的内容):

(matplotlib-dev)~$ pip install -e git+git://github.com/matplotlib/matplotlib.git#egg=matplotlib-dev
Obtaining matplotlib from git+git://github.com/matplotlib/matplotlib.git#egg=matplotlib-dev
  Cloning git://github.com/matplotlib/matplotlib.git to ./src/matplotlib
...
Installing collected packages: matplotlib
  Running setup.py develop for matplotlib
Successfully installed matplotlib-1.5.0+337.g595868a

(matplotlib-dev)~$ python -c "import matplotlib; print(matplotlib.__version__)"
1.5.0.post337+g595868a

(matplotlib-dev)~$ source deactivate
discarding /home/alistair/anaconda/envs/matplotlib-dev/bin from PATH

~$ python -c "import matplotlib; print(matplotlib.__version__)"
1.4.3

注意#egg= part,告诉pip将来源安装到./src/matplotlib-dev。如果您已经拥有当前正在处理的本地副本,则可以将git路径传递到本地源目录,而不是pip URI。

也应该可以使用conda develop <path>代替pip install -e <path>,但conda似乎不提供像pip那样的集成VCS支持。