ggplot2和qvalue错误:不知道如何自动为qvalue类型的对象选择比例

时间:2015-11-10 10:35:41

标签: r ggplot2 q-value

我有一个由1893个p值组成的数据框,我使用R包qvalue转换为q值:

pvals <- read.table("p_values.csv",header=T,sep=",",dec=".")

qvalue手册指出你可以通过以下方式直接绘制(使用qplot函数)qvalue函数的输出:

qobj <- qvalue(pvals)
qplot(qobj)

然而,这会导致错误:

  

不知道如何自动为qvalue类型的对象选择比例。   在as.data.frame.default(x [[i]]中默认为连续错误,   optional = TRUE,stringsAsFactors = stringsAsFactors):不能   coerce class&#34;&#34; qvalue&#34;&#34;到data.frame

任何人都知道如何解决这个问题并让qplot绘制qvalue函数的输出?

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