我有一个由1893个p值组成的数据框,我使用R包qvalue
转换为q值:
pvals <- read.table("p_values.csv",header=T,sep=",",dec=".")
qvalue手册指出你可以通过以下方式直接绘制(使用qplot函数)qvalue函数的输出:
qobj <- qvalue(pvals)
qplot(qobj)
然而,这会导致错误:
不知道如何自动为qvalue类型的对象选择比例。 在as.data.frame.default(x [[i]]中默认为连续错误, optional = TRUE,stringsAsFactors = stringsAsFactors):不能 coerce class&#34;&#34; qvalue&#34;&#34;到data.frame
任何人都知道如何解决这个问题并让qplot
绘制qvalue
函数的输出?