我有以下代码部分,它将TFIDF的一组推文映射到原始单词,然后用于查找每个群集中的顶级单词:</ p>
#document = sc.textFile("<text file path>").map(lambda line: line.split(" "))
#"tfidf" is an rdd of tweets contained in "document"
#map tfidf to original tweets and cluster similar tweets
clusterIds = clusters.predict(tfidf)
mapped_value = clusterIds.zip(document)
cluster_value = mapped_value.reduceByKey(lambda a,b: a+b).take(cluster_num)
#Fetch the top 5 words from each cluster
topics = []
for i in cluster_value:
word_count = sc.parallelize(i[1])
topics.append(
word_count.map(lambda x: (x,1))
.reduceByKey(lambda x,y: x+y)
.takeOrdered(5, key=lambda x: -x[1]))
有更好的方法吗? 我在Spark UI上看到,在4个VM的集群上执行reduceByKey()操作时,我的代码需要大约70分钟,其中包含20.5 Gb的执行程序内存和2 GB的驱动程序内存。推文数量为500K。用于停用词和垃圾字符的文本文件大小为31 Mb。
答案 0 :(得分:2)
由于您未提供a Minimal, Complete, and Verifiable example,我只能假设document
rdd包含标记化文本。所以让我们创建一个虚拟的例子:
mapped_value = sc.parallelize(
[(1, "aabbc"), (1, "bab"), (2, "aacc"), (2, "acdd")]).mapValues(list)
mapped_value.first()
## (1, ['a', 'a', 'b', 'b', 'c'])
您可以做的一件事是同时聚合所有集群:
from collections import Counter
create_combiner = Counter
def merge_value(cnt, doc):
cnt.update(Counter(doc))
return cnt
def merge_combiners(cnt1, cnt2):
cnt1.update(cnt2)
return cnt1
topics = (mapped_value
.combineByKey(create_combiner, merge_value, merge_combiners)
.mapValues(lambda cnt: cnt.most_common(2)))
topics
## [(1, [('b', 4), ('a', 3)]), (2, [('a', 3), ('c', 3)])]
您可以通过将Counter
替换为普通dict
并手动计数/更新来进一步改进,但我认为不值得大惊小怪。
有什么好处?
首先,您减少了必须移动的数据量(序列化 - 转移 - 反序列化)。特别是,您不仅仅收集将数据发送回工人。
收集和发送是昂贵的,所以你应该避免它,除非它是唯一的选择。如果对整个数据集的聚合是昂贵的,那么优选的方法可能是重复filter
等效于这样的事情:
[rdd.filter(lambda (k, v): k == i).map(...).reduce(...)
for i in range(number_of_clusters)]
你只开始一份工作而不是每个集群的工作而且开始工作并不便宜(请参阅我对Spark MLLib's LassoWithSGD doesn't scale?的答案)。你在这里获得多少取决于许多集群。
由于数据没有平整,因此根本没什么可做的。连接列表不需要任何内容,需要大量复制。使用词典可以减少存储数据的数量,就地更新不需要副本。您可以通过调整merge_value
:
def merge_value(cnt, doc):
for v in doc:
cnt[v] += 1
return cnt1
附注: