令人惊讶地缓慢插入mongodb上限集合

时间:2015-11-04 11:57:29

标签: mongodb pymongo publish-subscribe throughput

我正在使用mongodb的上限集合+ tailable游标作为pubsub引擎,使用pymongo。 (这种方法被描述为here)。 我的环境包括几个主题,几个发布者和几十个订阅者。

这很有效,除了每隔一段时间我会遇到插入操作,需要很长时间才能完成

我的理解是mongodb可以支持插入> 10K docs / sec,这就是为什么我很惊讶单个插入操作可以采用 85ms 。 (我在生产环境中也观察过几次> 1秒,但是无法使用此SSCCE重现它。)

为了将延迟降至最低,日记功能被禁用,我使用最低写入问题,这有帮助,但没有解决问题。

导致此问题的原因以及如何解决?

这是 SSCCE 。我并行运行以下脚本两次:

import time, pymongo, pandas as pd
DBNAME = 'test5'
COLLNAME = 'abc'
mongo = pymongo.MongoClient()
#mongo[DBNAME].drop_collection(COLLNAME)
if DBNAME not in mongo.database_names():
    coll = mongo[DBNAME].create_collection(COLLNAME,
                                    capped = True, size = 50 * 1024 * 1024, max = 1024 * 1024,
                                    fsync = False,  # no delays please (FYI, journaling is disabled)
                                    #autoIndexId = False,
                                    )

tarr = []
for _ in range(1000):
    msg = dict.fromkeys([ 'f%d' % j for j in range(30) ], 'foo')
    t1 = time.time()
    coll.insert(msg)  # <-- INSERT() HERE
    tarr.append(time.time() - t1)
    time.sleep(1./100)  # 100 docs/sec. surely not too much load...

print pd.Series(tarr).describe()

输出继电器:

RUN1:
count    1000.000000
mean        0.001555
std         0.002712
min         0.000654
25%         0.001021
50%         0.001084
75%         0.001151
max         0.065006  <-- 65ms!! 
dtype: float64

RUN2:
count    1000.000000
mean        0.001733
std         0.004013
min         0.000717
25%         0.001043
50%         0.001069
75%         0.001120
max         0.084803  <-- 84ms!! 
dtype: float64

索引信息:

mongo[DBNAME][COLNAME].index_information()
> {u'_id_': {u'key': [(u'_id', 1)], u'ns': u'xxxxx', u'v': 1}}

mongodb info:

db version v3.2.0-rc0
git version: bf28bd20fa507c4d8cc5919dfbbe87b7750ae8b0
OpenSSL version: OpenSSL 1.0.1f 6 Jan 2014
allocator: tcmalloc
modules: none
build environment:
    distmod: ubuntu1404
    distarch: x86_64
    target_arch: x86_64

"storageEngine" : { "name" : "mmapv1", "supportsCommittedReads" : false }

journaling DISABLED
pymongo version = 3.0.3

实验期间iostat -xtm 5的输出:

*** BEFORE ***
11/08/2015 09:05:02 AM
avg-cpu:  %user   %nice %system %iowait  %steal   %idle
           6.11    0.95    0.49    0.10    0.00   92.35

Device:         rrqm/s   wrqm/s     r/s     w/s    rMB/s    wMB/s avgrq-sz avgqu-sz   await r_await w_await  svctm  %util
sda               0.00    10.20    0.00    6.80     0.00     0.08    24.71     0.14   20.12    0.00   20.12   2.82   1.92
dm-0              0.00     0.00    0.00   17.00     0.00     0.08     9.88     0.24   13.84    0.00   13.84   1.13   1.92
dm-1              0.00     0.00    0.00    0.00     0.00     0.00     0.00     0.00    0.00    0.00    0.00   0.00   0.00
dm-2              0.00     0.00    0.00    7.80     0.00     0.03     8.41     0.04    4.92    0.00    4.92   2.05   1.60
dm-3              0.00     0.00    0.00    0.00     0.00     0.00     0.00     0.00    0.00    0.00    0.00   0.00   0.00


*** DURING ***
11/08/2015 09:05:07 AM
avg-cpu:  %user   %nice %system %iowait  %steal   %idle
           9.25    0.26    0.55    0.26    0.00   89.67

Device:         rrqm/s   wrqm/s     r/s     w/s    rMB/s    wMB/s avgrq-sz avgqu-sz   await r_await w_await  svctm  %util
sda               0.00    13.60    0.00   40.60     0.00     0.59    29.52     4.84  119.15    0.00  119.15   1.60   6.48
dm-0              0.00     0.00    0.00   54.20     0.00     0.59    22.11     5.00   92.18    0.00   92.18   1.20   6.48
dm-1              0.00     0.00    0.00    0.00     0.00     0.00     0.00     0.00    0.00    0.00    0.00   0.00   0.00
dm-2              0.00     0.00    0.00    4.20     0.00     0.02     9.14     0.01    2.29    0.00    2.29   2.29   0.96
dm-3              0.00     0.00    0.00    0.00     0.00     0.00     0.00     0.00    0.00    0.00    0.00   0.00   0.00

11/08/2015 09:05:12 AM
avg-cpu:  %user   %nice %system %iowait  %steal   %idle
           8.02    0.26    0.41    0.44    0.00   90.88

Device:         rrqm/s   wrqm/s     r/s     w/s    rMB/s    wMB/s avgrq-sz avgqu-sz   await r_await w_await  svctm  %util
sda               0.00    19.00    0.00  109.80     0.00     0.63    11.82    22.95  209.01    0.00  209.01   1.84  20.24
dm-0              0.00     0.00    0.00  128.80     0.00     0.63    10.07    25.55  198.37    0.00  198.37   1.57  20.24
dm-1              0.00     0.00    0.00    0.00     0.00     0.00     0.00     0.00    0.00    0.00    0.00   0.00   0.00
dm-2              0.00     0.00    0.00    4.40     0.00     0.02     8.00     0.02    4.73    0.00    4.73   2.18   0.96
dm-3              0.00     0.00    0.00    0.00     0.00     0.00     0.00     0.00    0.00    0.00    0.00   0.00   0.00

11/08/2015 09:05:17 AM
avg-cpu:  %user   %nice %system %iowait  %steal   %idle
           5.81    0.27    0.39    0.16    0.00   93.37

Device:         rrqm/s   wrqm/s     r/s     w/s    rMB/s    wMB/s avgrq-sz avgqu-sz   await r_await w_await  svctm  %util
sda               0.00     8.40    0.00   24.80     0.00     0.29    24.19     0.26   10.55    0.00   10.55   1.94   4.80
dm-0              0.00     0.00    0.00   33.20     0.00     0.29    18.07     0.31    9.35    0.00    9.35   1.45   4.80
dm-1              0.00     0.00    0.00    0.00     0.00     0.00     0.00     0.00    0.00    0.00    0.00   0.00   0.00
dm-2              0.00     0.00    0.00    3.40     0.00     0.01     8.94     0.01    2.35    0.00    2.35   2.35   0.80
dm-3              0.00     0.00    0.00    0.00     0.00     0.00     0.00     0.00    0.00    0.00    0.00   0.00   0.00


*** AFTER ***
11/08/2015 09:05:22 AM
avg-cpu:  %user   %nice %system %iowait  %steal   %idle
           5.85    0.40    0.46    0.00    0.00   93.28

Device:         rrqm/s   wrqm/s     r/s     w/s    rMB/s    wMB/s avgrq-sz avgqu-sz   await r_await w_await  svctm  %util
sda               0.00     3.80    0.00    0.40     0.00     0.02    84.00     0.00    6.00    0.00    6.00   6.00   0.24
dm-0              0.00     0.00    0.00    4.20     0.00     0.02     8.00     0.03    7.81    0.00    7.81   0.57   0.24
dm-1              0.00     0.00    0.00    0.00     0.00     0.00     0.00     0.00    0.00    0.00    0.00   0.00   0.00
dm-2              0.00     0.00    0.00    1.60     0.00     0.01    11.00     0.00    0.00    0.00    0.00   0.00   0.00
dm-3              0.00     0.00    0.00    0.00     0.00     0.00     0.00     0.00    0.00    0.00    0.00   0.00   0.00

UPDATE :我们将mongodb切换到内存中运行(沿着描述的here行)。机器有足够的内存来维持它。令人惊讶的是,它没有帮助!我们在插入时间仍然看到相同的“尖峰”。发生了一些奇怪的事情。我不知道是什么导致了它。

更新:我们还升级到内存中的mongodb V3.2。相同的结果。

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

看起来问题是你在创建集合(调用create_collection)时只使用完全非阻塞写入,而不是在插入时。

您可以在MongoClient级别禁用写入确认:

mongo = pymongo.MongoClient(w=0)

或仅针对insert来电:

coll.insert(msg, w=0)

无论哪种方式,当我在使用WiredTiger存储的普通磁盘支持的3.2 MongoDB实例上本地尝试时,最大时间降至0.001。