闪亮应用中的RMarkdown

时间:2015-11-03 12:52:32

标签: r shiny r-markdown

问题

有没有办法在闪亮的应用程序中插入(并评估)RMarkdown脚本。 (注意,我不是在RMarkdown中寻找一个解释为here的闪亮应用程序,也不是在寻找有光泽的Markdown脚本(see Shiny Gallery Markdown))

我正在构建一个包含文本,方程式,代码块,图和交互元素的应用程序。为方便起见,我使用Markdown文件作为文本和方程式,并希望有时在两者之间绘图(即在RMarkdown中写入大部分内容)。由于闪亮的应用程序更复杂(我使用shinydashboard包括许多独特的功能),我宁愿使用不使用first link中描述的方法的选项。

最低工作示例是:

R-文件:

library(shiny)

ui <- shinyUI(
  fluidPage(
    includeMarkdown("RMarkdownFile.rmd")
  )
)
server <- function(input, output) {}

shinyApp(ui, server)

和&#34; RMarkdownFile.rmd&#34;在同一个文件夹中:

This is a text

$$ E(x) = 0 $$ 

```{r, eval = T}
plot(rnorm(100))
```

结果:

Shiny App

目标

如果我编织rmd - 文件,我想要的是输出: RMarkdown HTML page

具体来说,我想得到代码块的评估(绘制一些东西......),我想得到渲染的数学方程式。

有什么想法吗?

已编辑的解决方案

感谢@Bunk的输入,我选择使用命令rmd将所有md文件呈现给knit文件,然后将md个文件包含在闪亮的文件中app(我使用markdown而不是html,因为后者产生了方程式的一些问题)。最后,includeMarkdown包含在withMathJax中以确保正确显示方程式。

最终代码如下:

library(shiny)
library(knitr)

rmdfiles <- c("RMarkdownFile.rmd")
sapply(rmdfiles, knit, quiet = T)

ui <- shinyUI(
    fluidPage(
        withMathJax(includeMarkdown("RMarkdownFile.md"))
  )
)
server <- function(input, output) { }

shinyApp(ui, server)

2 个答案:

答案 0 :(得分:19)

我认为编织它并渲染UI应该可行。

library(shiny)
library(knitr)

ui <- shinyUI(
    fluidPage(
        uiOutput('markdown')
  )
)
server <- function(input, output) {
    output$markdown <- renderUI({
        HTML(markdown::markdownToHTML(knit('RMarkdownFile.rmd', quiet = TRUE)))
    })
}

shinyApp(ui, server)

答案 1 :(得分:4)

按照@ elevendollar的要求,这就是我最终使用的内容:

library(shiny)
library(knitr)

rmdfiles <- c("RMarkdownFile.rmd")
sapply(rmdfiles, knit, quiet = T)

ui <- shinyUI(
    fluidPage(
        withMathJax(includeMarkdown("RMarkdownFile.md"))
  )
)
server <- function(input, output) { }

shinyApp(ui, server)