Question

我试图在基于Alpine 3.1的docker容器中安装numpy。我使用以下Dockerfile：

return builder.parse(input);

当我收到以下错误时，此问题运行正常FROM alpine:3.1 RUN apk add --update make cmake gcc g++ gfortran RUN apk add --update python py-pip python-dev RUN pip install cython RUN pip install numpy：

pip install numpy

error: Command "gcc -fno-strict-aliasing -Os -fomit-frame-pointer -DNDEBUG -Os -fomit-frame-pointer -fPIC -Inumpy/core/include -Ibuild/src.linux-x86_64-2.7/numpy/core/include/numpy -Inumpy/core/src/private -Inumpy/core/src -Inumpy/core -Inumpy/core/src/npymath -Inumpy/core/src/multiarray -Inumpy/core/src/umath -Inumpy/core/src/npysort -I/usr/include/python2.7 -Ibuild/src.linux-x86_64-2.7/numpy/core/src/private -Ibuild/src.linux-x86_64-2.7/numpy/core/src/private -Ibuild/src.linux-x86_64-2.7/numpy/core/src/private -c build/src.linux-x86_64-2.7/numpy/core/src/npymath/ieee754.c -o build/temp.linux-x86_64-2.7/build/src.linux-x86_64-2.7/numpy/core/src/npymath/ieee754.o" failed with exit status 1会出现同样的错误。

我是否缺少任何配置/安装步骤？

Answer 1

如果您不需要从numpy安装pypi，则可以从alpine存储库安装它。包名为py-numpy，位于testing存储库中，请参阅here。最适合我的Dockerfile示例

FROM alpine:3.2
ADD repositories /etc/apk/repositories
RUN apk add --update python python-dev gfortran py-pip build-base py-numpy@community

repositories档案的内容

http://dl-cdn.alpinelinux.org/alpine/v3.2/main
@community http://dl-cdn.alpinelinux.org/alpine/edge/community

Answer 2

我自己一直遇到一些麻烦，长话短说，我会鼓励你问这是否真的值得麻烦。当你开始在堆栈中添加像pandas，gpus和scipy这样的东西时Numpy是巨大的，所以在高山上构建它的好处是有限的，当你的500GB空间开启时，使用Debian，Arch甚至Ubuntu的节省相对适中无论如何，这个图书馆。

有人说过，我把一张图片拼凑起来。我需要构建时依赖项musl-dev，linux-headers和g ++。我还需要从堆栈中添加openblas以便稍后在堆栈中添加某些内容，因此可能还需要一些依赖项。但我相信只需添加三个以前的库

apk --no-cache add musl-dev linux-headers g++

应足以防止您获得的gcc错误。您可以在https://hub.docker.com/r/o76923/alpine-numpy-stack/

查看图片

Answer 3

试试这个：

RUN apk --no-cache --update-cache add gcc gfortran python python-dev py-pip build-base wget freetype-dev libpng-dev openblas-dev
RUN ln -s /usr/include/locale.h /usr/include/xlocale.h
RUN pip install pandas

Answer 4

Alpine存储库py3-numpy中现在有一个软件包。尽管它无法正常工作。

实际上，py3-numpy将库安装到/usr/lib/python3.7/site-packages目录中，但是默认的Python模块路径不使用它：

$ docker run -it python:3-alpine sh
/ # apk add --update --no-cache py3-numpy
...
/ # python
>>> import numpy
>>> ... module not found ...
>>> import sys
>>> sys.path
['', '/usr/local/lib/python37.zip', '/usr/local/lib/python3.7', '/usr/local/lib/python3.7/lib-dynload', '/usr/local/lib/python3.7/site-packages']

我通过将$PYTHONPATH环境变量设置为/usr/lib个位于站点包中来解决此问题：

FROM python:3-alpine

RUN apk add --update --no-cache py3-numpy
ENV PYTHONPATH=/usr/lib/python3.7/site-packages

Answer 5

根据我的MsgBox，这大约是311MB：

magento2

（与此同时，docker images本身约为900MB）

您是否尝试未安装gcc？可能会发生冲突？不确定。这个对我来说是最小的numpy安装，想与大家分享。

Answer 6

具有优化功能，例如在构建后删除构建依赖关系并删除不需要的测试（它们在这里是因为我们正在构建模块，而不仅仅是安装它）：

FROM frolvlad/alpine-python3

RUN apk add --no-cache \
        --virtual=.build-dependencies \
        g++ file binutils \
        musl-dev python3-dev cython && \
    apk add libstdc++ openblas && \
    ln -s locale.h /usr/include/xlocale.h && \
    pip install numpy && \
    rm -r /root/.cache && \
    find /usr/lib/python3.*/ -name 'tests' -exec rm -r '{}' + && \
    find /usr/lib/python3.*/site-packages/ -name '*.so' -print -exec sh -c 'file "{}" | grep -q "not stripped" && strip -s "{}"' \; && \
    rm /usr/include/xlocale.h && \
    apk del .build-dependencies

结果大小约为157MB。

在Docker Alpine上安装numpy

6 个答案: