Question

在SGE / PBS中，我可以像在本地一样向群集提交二进制可执行文件。例如：

qsub -b y -cwd echo hello

将提交一个名为echo的作业，该作业写下＆＃34; hello＆＃34;到它的输出文件。

如何向SLURM提交类似的工作。它希望文件在第一行有一个hash-bang解释器。在SLURM我得到了

$ sbatch echo hello
sbatch: error: This does not look like a batch script.  The first
sbatch: error: line must start with #! followed by the path to an interpreter.
sbatch: error: For instance: #!/bin/sh

或使用pseuodo qsub：

$ qsub echo hello
There was an error running the SLURM sbatch command.
The command was:
'/cm/shared/apps/slurm/14.11.3/bin/sbatch echo hello  2>&1'
and the output was:
'sbatch: error: This does not look like a batch script.  The first
 sbatch: error: line must start with #! followed by the path to an interpreter.
 sbatch: error: For instance: #!/bin/sh
'

我不想写脚本，将#!/bin/bash放在顶部，将命令放在下一行，然后将它们提交给sbatch。有没有办法避免这项额外的工作？必须有一种更有成效的方式。

Answer 1

您可以使用--wrap参数自动将命令包装在脚本中。

类似的东西：

sbatch --wrap="echo hello"

在SLURM中运行没有顶级脚本的二进制文件

1 个答案: