R中出现在网络中的孤立节点

时间:2015-10-28 11:01:07

标签: r graph

我正在使用库(网络)并使用以下边缘列表来生成网络。

使用的命令:

library(network)
edgelist<-read.table("Filename")
net<-network(edgelist)
plot(net)

我观察到的是网络图中的孤立节点!任何人都可以帮助破译原因??我在Cytoscape中使用了相同的edgelist。它在那里运作完美。为什么它会导致R问题? enter image description here

以下是边缘清单:

7   2  
2   6  
3   2  
13  2  
1   2  
4   2  
5   2  
9   2  
25  29  
5   4  
13  8  
18  17  
5   15  
13  1  
22  8  
25  12  
21  11  
17  28  
18  8  
13  16  
33  20  
10  27  
12  4  
24  23  
12  1  
19  26  
4   3  
3   15  
8   11  
16  62  
36  8  
18  11  
10  62  
4   6  
4   1  
32  62  
12  16  
4   15  
17  30  
22  10  
34  11  
31  10  
9   6  
4   7  
24  20  
5   6  
1   6  
3   6  
9   7  
21  19  
35  23  
7   6  
10  8  
5   7  
1   7  
3   7  
1   3  
1   9  
5   1  
3   9  
5   3  
5   9  

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

找到原因! R网络库要求节点ID按顺序排列。其中一个ID是62,而没有ID在36到62之间的节点。它最终将这些ID隔离为顶点。一旦该问题得到修复,它就能很好地工作。