创建循环流程图（circos）

Question

我正在寻找一个应用程序来创建图片中的图表。我一直在使用gephi并尝试使用circos。 Gephi仍然处于测试阶段，并且为了获得图表，circos需要大量配置。我正在寻找一些更容易的东西，可以将csv文件转换成这样的图表。

Answer 1

在Python中，您可以使用

来自nxviz的
1. CircosPlot（曾经是circos）。这是由Eric Ma在Matplotlib之上开发的。请注意，文档似乎很少，但由于Eric没有为此付费（并且是博士生），我相信他会非常感谢帮助改进文档。
Bokeh提供的
2. Chord看起来不错，但我不确定调整显示方式有多简单（注意box_zoom工具会造成视觉扭曲，请关闭此功能 specifying the plot tools使用kwarg tools='pan,wheel_soom,save,reset'）
3. plotly

在R中，您可以使用

来自chordDiagram包的
1. circlize 来自chorddiag包
的
2. chorddiag