字符串列的分层图

Question

我有一个10行7列的数据框。每一行，列都是一个字符串。

我想知道是否有一个包可以对列进行分层聚类/着色？

例如，假设它是三列五行：

V1 V2 V3 V4 V5
a  a  c  d  e 
b  b  d  f  b
c  c  e  a  c
d  d  g  b  d
e  f  h  c  e

是否有一个包装会将V1 / V2显示为高度相关并绘制它？让我们说如果成对元素匹配则严格相关。

Answer 1

> d<-data.frame(V1=c('a','b','c','d','e'),V2=c('a','b','c','d','f'),V3=c('c','d','e','g','h'),V4=c('d','f','a','b','c'),V5=c('e','b','c','d','e'), stringsAsFactors=F)
> res<-outer(1:5,1:5, FUN=Vectorize(function(i,j) sum(d[,i]==d[,j]) ))
> res
     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,]    5    4    0    0    4
[2,]    4    5    0    0    3
[3,]    0    0    5    0    0
[4,]    0    0    0    5    0
[5,]    4    3    0    0    5

> library(corrplot)
> corrplot(res/5)

请参阅https://cran.r-project.org/web/packages/corrplot/vignettes/corrplot-intro.html了解更多绘图选项，包括群集。 注意：V1 / V2和V1 / V5与您的示例同样“高度相关”。