Question

我有一个像。的文件：

AAAAAA
AAAAAB
AAAAAC
AAAAAD
...

我想在其他节目中使用一行。我的脚本使用的是awk，它几乎已经完成，但仍然无效。有人可以帮忙吗？谢谢！

while read file.txt

line=`awk '{ print $0 ; next}' ../file.txt`

echo 'for aa in "$line": cmd._alt(string.lower(aa)) ; save $line.pdb' > script.pdb

do

pymol script.pdb

done

脚本应该分别读取file.txt的每一行，以使用'for aa in“$ line”中的行“：cmd._alt（string.lower（aa））;为pymol保存$ line.pdb'脚本。

因此预期输出应该是包含每个文件的文件夹：

AAAAAA.pdb AAAAAB.pdb AAAAAC.pdb

Answer 1

你可以尝试

while read -r line
do
    echo "for aa in \"$line\": cmd._alt(string.lower(aa)) ; save $line.pdb" > script.pdb
    pymol script.pdb
done < file.txt

如何使用awk逐行打印其他程序的结果？

1 个答案: