在同一页面上绘制多个ggplot2

时间:2015-10-21 11:20:10

标签: r loops plot ggplot2

我有一个工作循环,可以生成并保存目录中保存的每个文件中的各个图。

我想将单个文件中的所有返回的绘图绘制为多个页面上的2x2网格,但不能这样做。

我试图将列表对象保存在列表中

pltList <- list()
pltList[]

for (f in 1:length(files)){
plot_object <- ggplot2(...)  #make ggplot2 plot
print(plot_object)
pltList[[f]] <- plot_object  #save ggplot2 plot in list
}

jpeg(filename.jpg)
par(mfrow=c(2,2))  #to generate 2x2 plot per page
print(pltList[[1]])
print(pltList[[2]])
...
print(pltList[[f]])
dev.off()

问题在于,生成的已保存的.jpg文件仅包含最后一个图,而不是所有图中所有图的2x2网格,这就是我想要的。

修改

我的第一个问题是如何从列表中的循环中保存每个绘图 - 如何从列表中查看保存的对象以确保它们已正确保存? 当我print(pltList[1])时,结果输出为:

function (x, y, ...) 
UseMethod("plot")
<bytecode: 0x0000000010f43b78>
<environment: namespace:graphics>

而不是实际的情节。看起来这些图未按预期保存在列表中。我怎么能纠正这个? 希望一旦修复,你的绘图建议就会起作用。

2 个答案:

答案 0 :(得分:6)

我最近做了同样的事情。我使用了grid.arrange()

library(ggplot2)
library(gridExtra)
library(grid)

p1<-ggplot()+geom_line(aes(x=1:10,y=1:10))
p2<-ggplot()+geom_line(aes(x=1:10,y=1:10))
p3<-ggplot()+geom_line(aes(x=1:10,y=1:10)) 
p4<-ggplot()+geom_line(aes(x=1:10,y=1:10))
grid.arrange(p1,p2,p3,p4, ncol=1, top=textGrob("Multiple Plots", gp=gpar(fontsize=12, font = 2)))

enter image description here

答案 1 :(得分:5)

假设您需要一个PDF输出,其中每个页面都有多个绘制为一的图,例如:如果有12个绘图,则每页有4个绘图。

试试这个例子:

library(ggplot2)
library(cowplot)

# list of 12 dummy plots, only title is changing.
pltList <- lapply(1:12, function(i){
  ggplot(mtcars,aes(mpg,cyl)) +
    geom_point() +
    ggtitle(paste("Title",i))})

# outputs 3 jpeg files with 4 plots each.
for(i in seq(1,12,4))
ggsave(paste0("Temp",i,".jpeg"),
       plot_grid(pltList[[i]],
                 pltList[[i+1]],
                 pltList[[i+2]],
                 pltList[[i+3]],nrow = 2))

# or we can output into 1 PDF with 3 pages using print
pdf("TempPDF.pdf")
for(i in seq(1,12,4))
  print(plot_grid(pltList[[i]],
            pltList[[i+1]],
            pltList[[i+2]],
            pltList[[i+3]],nrow = 2))
dev.off()

修改

使用gridExtra的另一种方法,如@ user20650所示:

library(gridExtra)

#output as PDF
pdf("multipage.pdf")

#use gridExtra to put plots together
marrangeGrob(pltList, nrow=2, ncol=2)

dev.off()