如何从scipy.io创建Matlab结构数组?

时间:2015-10-19 11:09:36

标签: python matlab scipy

考虑以下Matlab代码:

pmod(1).name{1}  = 'regressor1';
pmod(1).param{1} = [1 2 4 5 6];
pmod(1).poly{1}  = 1; 
pmod(2).name{1}  = 'regressor2-1';
pmod(2).param{1} = [1 3 5 7]; 
pmod(2).poly{1}  = 1;

这会创建一个struct数组。数组中的每个结构都包含三个cell类型的字段。因此,我们在pmod中有以下层次结构:

pmod  // struct array
|
*- struct
|  |
|  *- cell  // contains 1 or more strings
|  *- cell  // contains 1 or more arrays
|  *- cell  // contains 1 or more arrays
|
*- struct [...]

我尝试使用scipy.io在Python中生成上述数据结构,以便将它们加载到Matlab中(SPM需要此层次结构)。

创建一个结构很简单,因为scipy.io.savemat将所有类型为str的dict保存为Matlab结构:

from scipy.io import savemat

struct = {
    'field1': 1,
    'field2': 2,
}

savemat('/tmp/p.mat', {'a_struct': struct})

但是,在尝试将其概括为struct array 时,我遇到了以下障碍:

struct_array = [struct, struct]
savemat('/tmp/p.mat', {'s_array': struct_array})

这不符合预期;在将p.mat加载到Matlab中时,我得到一个1x2 单元数组,而不是结构数组。

如何使用scipy.io创建结构数组?

注意:

  1. 我尝试过savemat('/tmp/p.mat', np.array(struct_array))savemat('/tmp/p.mat', np.array(struct_array, dtype=object)),但无济于事。

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

您可以使用np.core.records.fromarrays构建一个记录数组,该数组大致相当于MATLAB结构,并将由scip.io.savemat转换为MATLAB结构。

from numpy.core.records import fromarrays
from scipy.io import savemat

myrec = fromarrays([[1, 10], [2, 20]], names=['field1', 'field2'])
savemat('p.mat', {'myrec': myrec})

在MATLAB中打开时,会给出:

>> load('p.mat')
>> myrec

myrec = 

1x2 struct array with fields:

    field1
    field2