我试图让索引按最后一个轴对多维数组进行排序,例如
>>> a = np.array([[3,1,2],[8,9,2]])
我喜欢索引i
,
>>> a[i]
array([[1, 2, 3],
[2, 8, 9]])
根据numpy.argsort的文档,我认为应该这样做,但我收到了错误:
>>> a[np.argsort(a)]
IndexError: index 2 is out of bounds for axis 0 with size 2
编辑:我需要以相同的方式重新排列相同形状的其他数组(例如数组b
,使a.shape == b.shape
)......以便
>>> b = np.array([[0,5,4],[3,9,1]])
>>> b[i]
array([[5,4,0],
[9,3,1]])
答案 0 :(得分:10)
解决方案:
>>> a[np.arange(np.shape(a)[0])[:,np.newaxis], np.argsort(a)]
array([[1, 2, 3],
[2, 8, 9]])
你做对了,虽然我不会把它描述为欺骗索引。
也许这会有助于使其更清晰:
In [544]: i=np.argsort(a,axis=1)
In [545]: i
Out[545]:
array([[1, 2, 0],
[2, 0, 1]])
对于每一行, i
是我们想要的顺序。那就是:
In [546]: a[0, i[0,:]]
Out[546]: array([1, 2, 3])
In [547]: a[1, i[1,:]]
Out[547]: array([2, 8, 9])
要同时执行两个索引步骤,我们必须为第一维使用“列”索引。
In [548]: a[[[0],[1]],i]
Out[548]:
array([[1, 2, 3],
[2, 8, 9]])
可以与i
配对的另一个数组是:
In [560]: j=np.array([[0,0,0],[1,1,1]])
In [561]: j
Out[561]:
array([[0, 0, 0],
[1, 1, 1]])
In [562]: a[j,i]
Out[562]:
array([[1, 2, 3],
[2, 8, 9]])
如果i
标识每个元素的列,则j
指定每个元素的行。 [[0],[1]]
列数组也可以正常工作,因为它可以针对i
进行广播。
我想到了
np.array([[0],
[1]])
作为j
的'简称'。它们一起定义新数组的每个元素的源行和列。他们一起工作,而不是按顺序工作。
从a
到新数组的完整映射是:
[a[0,1] a[0,2] a[0,0]
a[1,2] a[1,0] a[1,1]]
def foo(a):
i = np.argsort(a, axis=1)
return (np.arange(a.shape[0])[:,None], i)
In [61]: foo(a)
Out[61]:
(array([[0],
[1]]), array([[1, 2, 0],
[2, 0, 1]], dtype=int32))
In [62]: a[foo(a)]
Out[62]:
array([[1, 2, 3],
[2, 8, 9]])
答案 1 :(得分:5)
我找到{{3}},有人遇到同样的问题。他们的关键是欺骗索引以正常工作......
repaint
答案 2 :(得分:1)
你也可以使用linear indexing
,这可能会提高性能,就像这样 -
M,N = a.shape
out = b.ravel()[a.argsort(1)+(np.arange(M)[:,None]*N)]
因此,a.argsort(1)+(np.arange(M)[:,None]*N)
基本上是用于映射b
以获得b
所需排序输出的线性索引。也可以在a
上使用相同的线性索引来获取a
的排序输出。
示例运行 -
In [23]: a = np.array([[3,1,2],[8,9,2]])
In [24]: b = np.array([[0,5,4],[3,9,1]])
In [25]: M,N = a.shape
In [26]: b.ravel()[a.argsort(1)+(np.arange(M)[:,None]*N)]
Out[26]:
array([[5, 4, 0],
[1, 3, 9]])
Rumtime测试 -
In [27]: a = np.random.rand(1000,1000)
In [28]: b = np.random.rand(1000,1000)
In [29]: M,N = a.shape
In [30]: %timeit b[np.arange(np.shape(a)[0])[:,np.newaxis], np.argsort(a)]
10 loops, best of 3: 133 ms per loop
In [31]: %timeit b.ravel()[a.argsort(1)+(np.arange(M)[:,None]*N)]
10 loops, best of 3: 96.7 ms per loop
答案 3 :(得分:0)
由于numpy 1.15中添加了新功能以使其更简单,因此上述答案现在已过时。 take_along_axis(https://docs.scipy.org/doc/numpy-1.15.1/reference/generated/numpy.take_along_axis.html)允许您执行以下操作:
>>> a = np.array([[3,1,2],[8,9,2]])
>>> np.take_along_axis(a, a.argsort(axis=-1), axis=-1)
array([[1 2 3]
[2 8 9]])