Question

当我在Windows上的Pycharm 4上运行时，我在此代码中出错：

PDBSumWWW = urllib.urlopen("https://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/pdbsum/data/seqdata.dat")
PDBSum = PDBSumWWW.read().splitlines()
PDBSumWWW.close()

这是错误消息：

追踪（最近一次通话）：文件“C：/Users/LuisAlberto/PycharmProjects/MSc/SeqPDBSumIRIndex.py”，第98行，in 主要（）文件“C：/Users/LuisAlberto/PycharmProjects/MSc/SeqPDBSumIRIndex.py”，第40行，主要 PDBSum = PDBSumWWW.read（）。splitlines（）的MemoryError

然而，当在Macbook Air上运行时，它不会发生。

我该如何克服这个？

Answer 1

这是我能想到解决问题的最简单的解决方案。
在这个解决方案中，for循环将迭代数据库中的每一行。
每一行都将分配给line变量。

PDBSumWWW = urllib.urlopen("https://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/pdbsum/data/seqdata.dat")
for line in PDBSumWWW:
    # Do necessary calculations. 
PDBSumWWW.close()

内存错误Python处理大型数据库时

1 个答案: