比较两个列表时查找匹配的字符串

时间:2015-10-14 00:20:30

标签: python list dna-sequence

我试图比较两个列表,看看列表中是否有匹配的字符串。

我们可以说list_1

['GAAGGTCGAA', 'GAAGGTCGA', 'AAGGTCGAA', 'GAAGGTCG', 'AAGGTCGA', 'AGGTCGAA', 'GAAGGTC', 'AAGGTCG', 'AGGTCGA', 'GGTCGAA', 'GAAGGT', 'AAGGTC', 'AGGTCG', 'GGTCGA', 'GTCGAA', 'GAAGG', 'AAGGT', 'AGGTC', 'GGTCG', 'GTCGA', 'TCGAA', 'GAAG', 'AAGG', 'AGGT', 'GGTC', 'GTCG', 'TCGA', 'CGAA', 'GAA', 'AAG', 'AGG', 'GGT', 'GTC', 'TCG', 'CGA', 'GAA', 'GA', 'AA', 'AG', 'GG', 'GT', 'TC', 'CG', 'GA', 'AA', 'G', 'A', 'A', 'G', 'G', 'T', 'C', 'G', 'A', 'A']

list_2

['CCTCGGGA', 'CCTCGGG', 'CTCGGGA', 'CCTCGG', 'CTCGGG', 'TCGGGA', 'CCTCG', 'CTCGG', 'TCGGG', 'CGGGA', 'CCTC', 'CTCG', 'TCGG', 'CGGG', 'GGGA', 'CCT', 'CTC', 'TCG', 'CGG', 'GGG', 'GGA', 'CC', 'CT', 'TC', 'CG', 'GG', 'GG', 'GA', 'C', 'C', 'T', 'C', 'G', 'G', 'G', 'A', '', '', '', '', '', '', '', '', '', 'CCTCGGG', '', '', '', '', '', '', '', '', '']

我知道" TCG"在两个列表中,但我可以使用什么类型的函数来确定python中的这个?我尝试了for循环和许多其他内置函数,但我无法使其工作。

3 个答案:

答案 0 :(得分:4)

bool(set(list_1) & set(list_2))

答案 1 :(得分:2)

set

实际上很容易
print set(list_1) & set(list_2)
print bool(set(list_1) & set(list_2))
#set(['A', 'C', 'G', 'CG', 'GG', 'T', 'GA', 'TCG', 'TC']) //common strings
#true //Boolean result

<强>样本

http://ideone.com/y0GltE

答案 2 :(得分:0)

如果你需要的不仅仅是一个布尔变量,这是一个使用for循环的解决方案。

for item1 in list1:
    for item2 in list2:
        if item1 == item2:
            print item1