awk数组输出行数和平均值

Question

感谢@karakfa，下面的awk数组会产生输出。我正在尝试将$2添加到数组并输出它。 $2基本上是唯一条目出现的次数。当我正在使用awk阵列时，我不知道我的尝试是否接近。

输入：

chr1:955542-955763  AGRN:exon.1 1   0
chr1:955542-955763  AGRN:exon.1 2   0
chr1:985542-985763  AGRN:exon.2 1   0
chr1:985542-985763  AGRN:exon.2 2   1

我的剧本：

awk '{k=$1 OFS $2;
    l=$2;  # Is this correct?
    s[k]+=$4; c[k]++}
  END{for(i in s)  # Is this correct?
    print i, s[i]/c[i]},
      "(lbases)"  # Is this correct?' input

当前输出：

chr1:955542-955763 AGRN:exon.1 0
chr1:985542-985763 AGRN:exon.2 0.5

期望的输出：

chr1:955542-955763 AGRN:exon.1 0   (2 bases)
chr1:985542-985763 AGRN:exon.2 0.5 (2 bases)

Answer 1

您尝试引入新变量不会起作用。每个数组键需要一个计数，因此该变量应该是另一个数组。但在这种情况下，您不需要添加新数组，因为数组$2已经包含每个键的计数。

$1

另请注意您的尝试是如何不幸地拥有＆＃34; base＆＃34;在$2区块的右大括号外面。

这与问题描述的不同之处在于，密钥不是$2，而是type和enum的组合。如果你真的需要密钥只是getResource()，你需要一个新的数组，但是整个事情会变得更加复杂。