Question

在bash中将因子向量（并非所有级别都是唯一的）转换为数字向量的最有效方法是什么？数字向量中的值无关紧要，只要每个值代表因子的唯一级别即可。

为了说明，这将是R等同于我想要在bash中做的事情：

数字＆LT; -seq_along（水平（因子））[因子]

即：

factor

AV1019A
  ABG1787
  AV1019A
  B77hhA
  B77hhA

数字

1
  2
  1
  3
  3

非常感谢。

Answer 1

这可能不是最有效的，但也许是要开始的事情。

#!/bin/bash

input_data=$( mktemp ) 
map_file=$( mktemp )

# your example written to a file 
echo -e "AV1019A\nABG1787\nAV1019A\nB77hhA\nB77hhA" >> $input_data 

# create a map <numeric, factor> and write to file
idx=0
for factor in $( cat $input_data | sort -u )
do 
    echo $idx $factor
    let idx=$idx+1
done > $map_file 

# go through your file again and replace values with keys 
while read line
do 
    key=$( cat $map_file | grep -e ".* ${line}$" | awk '{print $1}' )
    echo $key
done < $input_data 

# cleanup 
rm -f $input_data $map_file

我最初想要使用关联数组，但它只是一个bash 4+功能，并不在这里和那里提供。如果你有bash 4那么你有一个文件少，这显然更有效。

#!/bin/bash

# your example written to a file 
input_data=$( mktemp )
echo -e "AV1019A\nABG1787\nAV1019A\nB77hhA\nB77hhA" >> $input_data 

# declare an array 
declare -a factor_map=($( cat $input_data | sort -u | tr "\n" " " ))

# go through your file replace values with keys 
while read line
do 
    echo ${factor_map[@]/$line//} | cut -d/ -f1 | wc -w | tr -d ' '
done < $input_data 

# cleanup 
rm -f $input_data

在bash中将因子转换为数字

1 个答案: