Question

我在Mac系统上使用Emacs和/或Aquamacs来编辑R，latex和html代码。在将OS X升级到el Capitan之后，R停止工作（搜索程序：没有这样的文件或目录，R）。我想知道是否有人遇到同样的问题并找到了解决方案。

Answer 1

这就是我所做的，它解决了这个问题。

重新安装R（撰写本文时的最新版本为3.2.4）
在.emacs中包含（setq exec-path（cons＆＃34; / usr / local / bin＆＃34; exec-path））。 / usr / local / bin是命令行R软链接的地方。

当然如果在/ usr / local / bin中找不到R命令但在其他地方找不到，则应该在步骤2中更改路径。

Answer 2

我必须在升级后重新安装R和所有软件包。为了能够轻松完成此步骤，请在升级到El Capitan之前将已安装的软件包保存在文件中。这些包实际上并没有被删除，而是存在于 /Library/Frameworks/R.Framework/Versions/3.2/Resources/library(3.2 =版本），所以您仍然可以找到它们，但有些可能在您的用户库中。</ p>

保存您的包裹清单：

my.packages = library（）[[2]] write.table（my.packages，file =＆＃34; my.packages.txt＆＃34;，row.names = F，col.names = T）

然后升级，从R-3.2.2.pkg（或最新版本）重新安装，然后读取my.packages中的文本文件并使用install.packages（my.packages，repos =＆＃39; {{3你应该好好去。

Answer 3

关于＆＃34; El Capitan＆＃34;下的R，你不一定要重新安装它。您可以通过列出目录

找出发生的情况

ls -l /Library/SystemMigration/History/Migration-<UUID>/QuarantineRoot/usr/bin

（<uuid>看起来像38CF2251-9593-48E9-BAA4-4880AA47E908）。这是操作系统升级将以前的链接放在/usr/bin中的位置。只需以root身份创建与R和Rscript相同的符号链接：

cd /usr/local/bin
ln -s /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R R
ln -s /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/Rscript Rscript

当然，这假设您/usr/local/bin中有PATH。

R的新装置应该了解El Capitan的变化，参见this R bug report

Answer 4

这是另一种解决方案：将emacs替换为“已修改的emacs＆＃39;＆＃39;”。它解决了Auctex（latex-preview-pane-mode）和R的所有问题。它也与OS 10.11一致。

您可以从以下网址下载：http://vgoulet.act.ulaval.ca/en/emacs/mac/

Answer 5

我有同样的问题让R在El Capitan上运行。问题现在解决了。接下来是我尝试过的。您可能会发现一些步骤无关紧要，但为了完整起见，我已将它们包括在内。

尝试通过自制程序重新安装它（上面的mentioined）并得到一条关于el capitan的不兼容的消息。
加载的＆＃39;修改过的emacs＆＃39; （如上所述）。
访问以下链接： http://ftp.heanet.ie/mirrors/cran.r-project.org/bin/macosx/

然后下载并安装：（i）R-3.2.2.pkg 并按照说明在终端中运行校验和命令。（ii）XQuartz 4.然后在终端输入R 它起作用了。

对于我正在做的课程，需要其他软件包或库。要在终端类型中加载包＆＃39; geonames，请执行以下操作： install.packages（C（＆＃34; GEONAMES＆＃34））

将出现一条消息，要求您选择CRAN镜像。另外一个窗口将打开一个镜像列表，单击一个，然后单击确定。

同样，包装＆＃39; UsingR＆＃39;被加载： install.packages（C（＆＃34; UsingR＆＃34））

__端

Answer 6

我认为问题是for(int x=0; x<gameboard.length; x++) { gameboard[x] = new GameBoard(); //Assuming you want to use the default constructor }不再可写。这就是usr/bin和R等程序所在的地方。在我的系统上，看起来Rscript被移动到类似：

usr/bin

我想您可以将隔离文件夹添加到您的路径中，因为在我的系统上，如果从那里执行，一切似乎都正常。

Answer 7

我遇到了同样的问题。我不确定在El Capitan中发生了什么变化，但在我的/usr/local/bin文件中将R二进制文件（.emacs）的路径添加到exec-path修复了问题对我来说。

Mac，R和OS X el Capitan上的Emacs

7 个答案: