当我从netCDF文件重新分析(可变压力(SLP),01/01/2014)中提取数据时,数据的分辨率非常高(9km网格),这使得生成的图像非常嘈杂。我想将数据放入较低分辨率的网格(例如1度)。我正在尝试使用meshgrid和gridata函数,但缺乏经验无法使其工作。有谁知道如何解决?谢谢。
from netCDF4 import Dataset
import numpy as np
from scipy.interpolate import griddata
file = Dataset('slp_2014_01_01.nc', 'r')
# Printing variables
print ' '
print ' '
print '----------------------------------------------------------'
for i,variable in enumerate(file.variables):
print ' '+str(i),variable
if i == 2:
current_variable = variable
print ' '
print 'Variable: ', current_variable.upper()
print 'File name: ', file_name
lat = file.variables['lat'][:]
lon = file.variables['lon'][:]
slp = file.variables['slp'][:]
lon_i = np.linspace(lon[0], lon[len(REANALYSIS_lon)-1], num=len(lon)*2, endpoint=True, retstep=False)
lat_i = np.linspace(lat[0], lat[len(lat)-1], num=len(lat)*2, endpoint=True, retstep=False)
lon_grid, lat_grid = np.meshgrid(lon_i,lat_i)
temp_slp = np.asarray(slp).squeeze()
new_slp = temp_slp.reshape(temp_slp.size)
slp_grid = griddata((lon, lat), new_slp, (lon_grid, lat_grid),method='cubic')
正如我所提到的,我尝试使用meshgrid和datagrid函数,但产生了以下错误:
追踪(最近一次通话):
文件“REANALYSIS_LOCAL.py”,第346行,在
LON,经纬度,时间,VAR,variavel_atual = netCDF_builder_local(caminho_netcdf_local,nome_arquivo,DT)
文件“REANALYSIS_LOCAL.py”,第143行,在netCDF_builder_local中
slp_grid = griddata((lon,lat),new_slp,(lon_grid,lat_grid),method ='cubic')
在griddata中输入文件“/home/carlos/anaconda/lib/python2.7/site-packages/scipy/interpolate/ndgriddata.py”,第182行
points = _ndim_coords_from_arrays(points)
文件“interpnd.pyx”,第176行,在scipy.interpolate.interpnd._ndim_coords_from_arrays(scipy / interpolate / interpnd.c:4064)中
在broadcast_arrays中输入文件“/home/carlos/anaconda/lib/python2.7/site-packages/numpy/lib/stride_tricks.py”,第101行
“轴%r上的尺寸不兼容。” %(轴,))
ValueError:形状不匹配:两个或多个数组在轴0上具有不兼容的尺寸。
变量的维度是:
lon:(144,)
lat:(73,)
lon_i:(288,)
lat_i:(146,)
lon_grid:(146,288)
lat_grid:(146,288)
new_slp:(10512,)
new_slp中的值是: new_slp:[102485。102485. 102485。...,100710。100710. 100710.]
目的是增加变量(lon,lat和slp)中的值,因为Reanalysis分辨率更高。然后,分辨率可能是最详细的(更多点)。
例如:变量lat有点:
原始尺寸变量lat:(73,)
纬度:[90.87.5 85. 82.5 80. 77.5 75. 72.5 70. 67.5 65. 62.5
60. 57.5 55. 52.5 50. 47.5 45. 42.5 40. 37.5 35. 32.5
30. 27.5 25. 22.5 20. 17.5 15. 12.5 10. 7.5 5. 2.5
0. -2.5 -5。 -7.5 -10。 -12.5 -15。 -17.5 -20。 -22.5 -25。 -27.5
-30。 -32.5 -35。 -37.5 -40。 -42.5 -45。 -47.5 -50。 -52.5 -55。 -57.5
-60。 -62.5 -65。 -67.5 -70。 -72.5 -75。 -77.5 -80。 -82.5 -85。 -87.5
-90。 ]
当我定义代码行时:lat_i = np.linspace(lat [0],lat [len(lat)-1],num = len(lat)* 2,endpoint = True,retstep = False)我加倍lat变量la_i(146,)
的值 lat _i:[90。88.75862069 87.51724138 86.27586207 85.03448276 83.79310345 82.55172414 81.31034483 80.06896552 78.82758621 77.5862069
...
-78.82758621 -80.06896552 -81.31034483 -82.55172414 -83.79310345 -85.03448276 -86.27586207 -87.51724138 -88.75862069 -90。 ]
我需要的想法与此代码相同,其中x为lon,y为lat,slp为z。
来自scipy.interpolate import griddata
导入numpy为np
将matplotlib.pyplot导入为plt
x=np.linspace(1.,10.,20)
y=np.linspace(1.,10.,20)
z=z = np.random.random(20)
xi=np.linspace(1.,10.,40)
yi=np.linspace(1.,10.,40)
X,Y= np.meshgrid(xi,yi)
Z = griddata((x, y), z, (X, Y),method='nearest')
plt.contourf(X,Y,Z)
答案 0 :(得分:3)
根据您的最终目的,您可以使用cdo重新编译整个文件
cdo remapbil,r360x180 infile outfile
或者只是从原始文件中绘制每秒或第三个值,如下所示:
plt.pcolormesh(lon[::2,::2],lat[::2,::2],var1[::2,::2])
您显示的错误消息只是说维度不多,只是在出现错误之前打印变量的形状并尝试使其正常工作。
为什么您的代码不起作用? 您选择的方法需要输入坐标为lon,lat对数据点,而不是网格坐标。如果数据点的形状为10000,则坐标必须为形状(10000,2),而不是(100,100)。 但由于griddata适用于非结构化数据,因此无法满足您的需求,我建议使用类似scipy.interpolate.RegularGridInterpolator
的内容。但无论如何,如果您需要多次使用插值数据,我建议使用cdo创建新的netCDF文件并处理它们,而不是每次运行脚本时插入数据。
答案 1 :(得分:0)
感谢您的帮助。真的,我的问题是关于尺寸。我正在学习使用海洋学数据。所以,我用这段代码解决了这个问题。
lonbounds = [25,59]
latbounds = [-10,-33]
#longitude lower and upper index
lonli = np.argmin(np.abs(lon - lonbounds[0]))
lonui = np.argmin(np.abs(lon - lonbounds[1]))
#latitude lower and upper index
latli = np.argmin(np.abs(lat - latbounds[0]))
latui = np.argmin(np.abs(lat - latbounds[1]))
#limiting of the interest region/data
lon_f = file.variables['lon'][lonli:lonui]
lat_f = file.variables['lat'][latli:latui]
slp_f = file.variables['slp'][0,latli:latui,lonli:lonui]
#creating a matrix with the filtered data (area to be searched) for use in gridData function of python
lon_f_grid, lat_f_grid = np.meshgrid(lon_f,lat_f)
#adjusting the data (size 1) for use in gridData function of python
lon_f1 = lon_f_grid.reshape(lon_f_grid.size)
lat_f1 = lat_f_grid.reshape(lat_f_grid.size)
slp_f1 = slp_f.reshape(slp_f.size)
#increasing the resolution of data (1000 points) of longitude and latitude for the data to be more refined
lon_r = np.linspace(lon_f[0], lon_f[len(lon_f)-1], num=1000, endpoint=True, retstep=False)
lat_r = np.linspace(lat_f[0], lat_f[len(lat_f)-1], num=1000, endpoint=True, retstep=False)
#creating a matrix with the filtered data (area to be searched) and higher resolution for use in gridData function of python
lon_r_grid, lat_r_grid = np.meshgrid(lon_r,lat_r)
#applying gridata that can be generated since pressure (SLP) with higher resolution.
slp_r = griddata((lon_f1,lat_f1),slp_f1,(lon_r_grid,lat_r_grid),method='cubic')
拥抱, 卡洛斯。